RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 TAS2R50P59544 299 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 TMEM236Q5W0B7 351 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 NXPE4Q6UWF7 544 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 RNF130Q86XS8 419 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 HS3ST5Q8IZT8 346 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 FAR1Q8WVX9 515 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 RFKQ969G6 155 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 MOAP1Q96BY2 351 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 HHIPL1Q96JK4 782 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 FERD3LQ96RJ6 166 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 SPHK2Q9NRA0 654 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 PHF11Q9UIL8 331 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 SNX7Q9UNH6 387 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 ABCG2Q9UNQ0 655 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 SLC30A4O14863 429 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 ADAM12O43184 909 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 TBX1O43435 398 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 VEGFDO43915 354 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 LEFTY1O75610 366 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 ADAP00813 363 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 CCNYL3P0C7X3 344 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 PAICSP22234 425 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 SSR2P43308 183 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 CRISP1P54107 249 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 TAS2R41P59536 307 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 LAPTM4AQ15012 233 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 QPRTQ15274 297 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 GPAT3Q53EU6 434 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 Q6ZVL8 140 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 VTCN1Q7Z7D3 282 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 CLECL1Q8IZS7 167 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 NAT16Q8N8M0 369 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 FAM129BQ96TA1 746 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 PKP4Q99569 1192 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 PELI2Q9HAT8 420 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 MS4A12Q9NXJ0 267 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 MED16Q9Y2X0 877 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 ASB1Q9Y576 335 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 A0A1B0GTL3 188 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 SOBPA7XYQ1 873 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 FAM25AB3EWG3 89 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 FAM25CB3EWG5 89 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 FAM25GB3EWG6 89 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 E7EQ34 232 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 AP3D1O14617 1153 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 ANKRD28O15084 1053 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 CCNKO75909 580 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 TGFB1P01137 390 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 CDK1P06493 297 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 ETV3P41162 512 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 ST3GAL4Q11206 333 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 LAPTM4BQ86VI4 370 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 AMZ2Q86W34 360 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 SLC43A3Q8NBI5 491 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 SMPDL3AQ92484 453 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 P2RY13Q9BPV8 354 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 CNPPD1Q9BV87 410 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 NDEL1Q9GZM8 345 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 KCNK5O95279 499 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 OPN1SWP03999 348 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 RAB25P57735 213 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 TSTQ16762 297 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 LRRC73Q5JTD7 316 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 TRAF7Q6Q0C0 670 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 SYNPOQ8N3V7 929 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 BBS10Q8TAM1 723 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 NDNFQ8TB73 568 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 C16orf78Q8WTQ4 265 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 CAPNS2Q96L46 248 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 MROQ9BYG7 248 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 C11orf16Q9NQ32 467 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 DEC1Q9P2X7 70 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 PRKAR1AP10644 381 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 SEPHS1P49903 392 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 MTAPQ13126 283 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 SNAPC1Q16533 368 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 POM121L1PQ3SYA9 428 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 DGKKQ5KSL6 1271 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 C16orf62Q7Z3J2 963 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 OR52L1Q8NGH7 329 aa8.5□□□□□ -1.05
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