RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229270.8

TPI1-201, Transcript of triosephosphate isomerase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TPI1, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPI1-201ENST00000229270 CLEC1BQ9P126 229 aa25.23■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 ATP6V1HQ9UI12 483 aa25.23■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 FZD4Q9ULV1 537 aa25.23■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 VPS4AQ9UN37 437 aa25.23■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 NADKO95544 446 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 LTBRP36941 435 aa25.23■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 RBBP4Q09028 425 aa25.23■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 MESP2Q0VG99 397 aa25.23■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 RGNQ15493 299 aa25.23■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 ADCK1Q86TW2 530 aa25.23■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 C11orf65Q8NCR3 313 aa25.23■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 SLC38A4Q969I6 547 aa25.23■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 DACH2Q96NX9 599 aa25.23■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 PSD2Q9BQI7 771 aa25.23■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 ERVK-11Q9UQG0 969 aa25.23■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 A3GALT2U3KPV4 340 aa25.23■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 ARHGEF33A8MVX0 844 aa25.22■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 ADAMDEC1O15204 470 aa25.22■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 WBP4O75554 376 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 CATP04040 527 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 CYP4B1P13584 511 aa25.22■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 PSMB9P28065 219 aa25.22■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 KRT20P35900 424 aa25.22■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 CBX3Q13185 183 aa25.22■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa25.22■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 CLECL1Q8IZS7 167 aa25.22■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 REPS1Q96D71 796 aa25.22■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa25.22■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 SELENONQ9NZV5 590 aa25.22■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 DAPK2Q9UIK4 370 aa25.22■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa25.21■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 IDSP22304 550 aa25.21■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 RAE1P78406 368 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 IL1RL1Q01638 556 aa25.21■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 ELP6Q0PNE2 266 aa25.21■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 TANGO2Q6ICL3 276 aa25.21■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 ANKRD54Q6NXT1 300 aa25.21■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 SYCE2Q6PIF2 218 aa25.21■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 AGTRAPQ6RW13 159 aa25.21■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 VPS35Q96QK1 796 aa25.21■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 GABRR3A8MPY1 467 aa25.21■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 ANXA8P13928 327 aa25.21■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 RPL3P39023 403 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 TUBA3EQ6PEY2 450 aa25.21■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 VITQ6UXI7 678 aa25.21■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa25.21■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 SLC22A15Q8IZD6 547 aa25.21■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 NDNFQ8TB73 568 aa25.21■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 MYDGFQ969H8 173 aa25.21■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 SH3KBP1Q96B97 665 aa25.21■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 ITPAQ9BY32 194 aa25.21■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 FKBP14Q9NWM8 211 aa25.21■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 OSGIN1Q9UJX0 560 aa25.21■■□□□ 1.63
TPI1-201ENST00000229270 COL6A3P12111 3177 aa25.2■■□□□ 1.62
TPI1-201ENST00000229270 YY2O15391 372 aa25.2■■□□□ 1.62
TPI1-201ENST00000229270 PRNPP04156 253 aa25.2■■□□□ 1.62
TPI1-201ENST00000229270 NR4A1P22736 598 aa25.2■■□□□ 1.62
TPI1-201ENST00000229270 XPAP23025 273 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
TPI1-201ENST00000229270 GGT2P36268 569 aa25.2■■□□□ 1.62
TPI1-201ENST00000229270 TGFBR2P37173 567 aa25.2■■□□□ 1.62
TPI1-201ENST00000229270 MMP12P39900 470 aa25.2■■□□□ 1.62
TPI1-201ENST00000229270 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
TPI1-201ENST00000229270 SELENOWP63302 87 aa25.2■■□□□ 1.62
TPI1-201ENST00000229270 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
TPI1-201ENST00000229270 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
TPI1-201ENST00000229270 ENTHD1Q8IYW4 607 aa25.2■■□□□ 1.62
TPI1-201ENST00000229270 TMIEQ8NEW7 156 aa25.2■■□□□ 1.62
TPI1-201ENST00000229270 APH1BQ8WW43 257 aa25.2■■□□□ 1.62
TPI1-201ENST00000229270 LGALS12Q96DT0 336 aa25.2■■□□□ 1.62
TPI1-201ENST00000229270 BTBD2Q9BX70 525 aa25.2■■□□□ 1.62
TPI1-201ENST00000229270 ABCG8Q9H221 673 aa25.2■■□□□ 1.62
TPI1-201ENST00000229270 SGK2Q9HBY8 427 aa25.2■■□□□ 1.62
TPI1-201ENST00000229270 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa25.2■■□□□ 1.62
TPI1-201ENST00000229270 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa25.19■■□□□ 1.62
TPI1-201ENST00000229270 E7EQ34 232 aa25.19■■□□□ 1.62
TPI1-201ENST00000229270 PCDHGA12O60330 932 aa25.19■■□□□ 1.62
TPI1-201ENST00000229270 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
TPI1-201ENST00000229270 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.62
TPI1-201ENST00000229270 CCR3P51677 355 aa25.19■■□□□ 1.62
TPI1-201ENST00000229270 FCHO2Q0JRZ9 810 aa25.19■■□□□ 1.62
TPI1-201ENST00000229270 LAPTM4AQ15012 233 aa25.19■■□□□ 1.62
TPI1-201ENST00000229270 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
TPI1-201ENST00000229270 C9orf64Q5T6V5 341 aa25.19■■□□□ 1.62
TPI1-201ENST00000229270 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
TPI1-201ENST00000229270 CCDC80Q76M96 950 aa25.19■■□□□ 1.62
TPI1-201ENST00000229270 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
TPI1-201ENST00000229270 LACC1Q8IV20 430 aa25.19■■□□□ 1.62
TPI1-201ENST00000229270 ZNF366Q8N895 744 aa25.19■■□□□ 1.62
TPI1-201ENST00000229270 WDR34Q96EX3 536 aa25.19■■□□□ 1.62
TPI1-201ENST00000229270 CD84Q9UIB8 345 aa25.19■■□□□ 1.62
TPI1-201ENST00000229270 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa25.19■■□□□ 1.62
TPI1-201ENST00000229270 SLC5A10A0PJK1 596 aa25.18■■□□□ 1.62
TPI1-201ENST00000229270 AXIN1O15169 862 aa25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms