RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020163.6

Nedd1-201, Transcript of Protein NEDD1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nedd1, Length 3,534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Has1Q61647 583 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dmc1Q61880 340 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Syt16Q7TN83 639 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 NanogQ80Z64 305 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cpped1Q8BFS6 312 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cdkn2aipQ8BI72 563 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Catsper4Q8BVN3 442 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ptges2Q8BWM0 384 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 DcxrQ91X52 244 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Q922R1 422 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Use1Q9CQ56 270 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hyal6Q9D4E9 494 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Eef1akmt2Q9D853 244 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmod3Q9JHJ0 352 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 TescQ9JKL5 214 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Smarcb1Q9Z0H3 385 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 H2-BlV9GXR0 257 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Otud4B2RRE7 1107 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr173E9QAT7 321 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm12794L7MTS5 483 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 HpnO35453 436 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nfatc1O88942 717 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Bmp7P23359 430 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 HmgclP38060 325 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ripk1Q60855 656 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sohlh1Q6IUP1 357 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fam149b1Q6NSV7 578 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Klhl5Q6PFE1 708 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cd3eapQ76KJ5 399 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lrfn2Q80TG9 788 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pramel7Q810Y8 479 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pou6f2Q8BJI4 691 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cers6Q8C172 384 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 SdslQ8R238 329 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1346Q8VGH6 313 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gpx6Q91WR8 221 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nphs2Q91X05 385 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 MtapQ9CQ65 283 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 OoepQ9CWE6 164 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 3300002I08RikQ9CXH3 147 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cthrc1Q9D1D6 245 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmem269Q9D4Y8 254 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmem41aQ9D8U2 264 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Smad9Q9JIW5 430 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cyp4a32A2A8T1 509 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pex10B1AUE5 324 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Man2b2O54782 1018 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ccnb2P30276 398 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tap2P36371 702 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Serpind1P49182 478 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ap2m1P84091 435 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Yes1Q04736 541 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Eif1adQ3THJ3 170 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tamm41Q3TUH1 337 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Q3U7U4 132 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nfe2l1Q61985 741 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 BpiQ67E05 483 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Q810M1 233 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cpeb2Q812E0 521 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc35f1Q8BGK5 408 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pomt2Q8BGQ4 820 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Csgalnact1Q8BJQ9 530 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nceh1Q8BLF1 408 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fam46bQ8C152 427 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cox10Q8CFY5 443 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dnajc22Q8CHS2 339 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr771Q8VFH6 317 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vsx1Q91V10 363 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Adgrl4Q923X1 739 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 SmoxQ99K82 555 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cyp4f3Q99N16 524 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Creb3l4Q9D2A5 370 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 LhppQ9D7I5 270 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 DiabloQ9JIQ3 237 aa9.59□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm21964A0A1W2P7S4 437 aa9.59□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fam46aD3Z5S8 447 aa9.59□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mab21l1O70299 359 aa9.59□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc22a8O88909 537 aa9.59□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 FlgP11088 336 aa9.59□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 H2-D1P14427 368 aa9.59□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ano7Q14AT5 859 aa9.59□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Wdr75Q3U821 830 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 FuzQ3UYI6 415 aa9.59□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nxf3Q4ZGD9 553 aa9.59□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1198Q7TR12 308 aa9.59□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 SprnQ8BWU1 147 aa9.59□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hmgcs1Q8JZK9 520 aa9.59□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn1r192Q8K4C9 300 aa9.59□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn1r81Q8R286 306 aa9.59□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn1r185Q8R299 319 aa9.59□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slco3a1Q8R3L5 710 aa9.59□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 NrmQ8VC65 262 aa9.59□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 TipinQ91WA1 278 aa9.59□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Npffr2Q924H0 417 aa9.59□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gpr37l1Q99JG2 481 aa9.59□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Arhgap8Q9CXP4 425 aa9.59□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Alyref2Q9JJW6 218 aa9.59□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Stub1Q9WUD1 304 aa9.59□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Plxnb3Q9QY40 1902 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm13178B1AVU7 408 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 55.5 ms