RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 GPR153Q6NV75 609 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 NXPE4Q6UWF7 544 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 LRRTM3Q86VH5 581 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 RAB43Q86YS6 212 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 APCDD1Q8J025 514 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 THRSPQ92748 146 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 OSTF1Q92882 214 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 FBXL8Q96CD0 374 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 DIRAS2Q96HU8 199 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 SLC45A3Q96JT2 553 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 PDCD10Q9BUL8 212 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 G6PC3Q9BUM1 346 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 BRF2Q9HAW0 419 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 ADAP2Q9NPF8 381 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 SERTAD3Q9UJW9 196 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF222Q9UK12 451 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 C1orf226A1L170 272 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 GPR89AB7ZAQ6 455 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 RASAL1O95294 804 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 GPR89BP0CG08 455 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 POU2F1P14859 743 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 BPIP17213 487 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 VEGFBP49765 207 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 KCNC4Q03721 635 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 RUNX3Q13761 415 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 RCAN2Q14206 197 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 OR4D1Q15615 310 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 MEDAGQ5VYS4 303 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 NANOGP8Q6NSW7 305 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 SLC36A4Q6YBV0 504 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 CNTN4Q8IWV2 1026 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 FAM46DQ8NEK8 389 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 HERPUD2Q9BSE4 406 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 NANOGQ9H9S0 305 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 KCNK6Q9Y257 313 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 WNK3Q9BYP7 1800 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 SSC5DA1L4H1 1573 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 A0A1W2PQ72 361 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 IDH3BO43837 385 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 AK1P00568 194 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 CD9P21926 228 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 FMO3P31513 532 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 TAS2R43P59537 309 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 SLC7A9P82251 487 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 TAZQ16635 292 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 CNPY1Q3B7I2 92 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 GRHL2Q6ISB3 625 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF366Q8N895 744 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 OR10H4Q8NGA5 316 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 OR4K14Q8NGD5 310 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 PPP1R14BQ96C90 147 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 ALPK1Q96QP1 1244 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 SLC12A9Q9BXP2 914 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM138Q9NPI0 162 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 SEC14L4Q9UDX3 406 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 PRODH2Q9UF12 536 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 PLAGL1Q9UM63 463 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 JUNP05412 331 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 DHRS4L1P0CG22 281 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 ACADLP28330 430 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 HOXC13P31276 330 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 TBPL1P62380 186 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 GBX1Q14549 363 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 SLC8B1Q6J4K2 584 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 FAM180AQ6UWF9 173 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 DPPA4Q7L190 304 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 RNF130Q86XS8 419 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 TICAM1Q8IUC6 712 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM9Q9P0T7 183 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 FAM170BA6NMN3 283 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 FAAHO00519 579 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 TPST2O60704 377 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 ITGA10O75578 1167 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 KAT7O95251 611 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 FGF4P08620 206 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 SRCP12931 536 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 C6P13671 934 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 BMP8BP34820 402 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 NUDT1P36639 197 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
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