RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	PIPSL	A2A3N6	862 aa		12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	JRK	O75564	520 aa		12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	VIP	P01282	170 aa		12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	MT-ND2	P03891	347 aa		12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	TAS2R50	P59544	299 aa		12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	SLC35A2	P78381	396 aa		12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	TAP2	Q03519	686 aa		12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF33B	Q06732	778 aa		12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	C2orf80	Q0P641	193 aa		12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	NPRL3	Q12980	569 aa		12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	ATP1A4	Q13733	1029 aa		12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	CTF1	Q16619	201 aa		12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	AHSA2	Q719I0	299 aa		12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	CHST8	Q9H2A9	424 aa		12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	DKK3	Q9UBP4	350 aa		12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	IRAK3	Q9Y616	596 aa		12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	PCM1	Q15154	2024 aa		12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	PCDHGA12	O60330	932 aa		12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	CISD3	P0C7P0	127 aa		12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	SOAT1	P35610	550 aa		12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	PRIM2	P49643	509 aa		12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	PHEX	P78562	749 aa		12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	KEAP1	Q14145	624 aa		12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	SMYD1	Q8NB12	490 aa		12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	COQ8B	Q96D53	544 aa		12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	NUS1	Q96E22	293 aa		12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	DOHH	Q9BU89	302 aa		12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	REEP4	Q9H6H4	257 aa		12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	ASF1A	Q9Y294	204 aa		12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	C9	P02748	559 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	C6	P13671	934 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	PCSK2	P16519	638 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	KRT20	P35900	424 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	MASP1	P48740	699 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	VBP1	P61758	197 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	NFKBID	Q8NI38	313 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	ARRDC3	Q96B67	414 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	PPCDC	Q96CD2	204 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	COQ10A	Q96MF6	247 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	LTBP2	Q14767	1821 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	MVD	P53602	400 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	NR1D2	Q14995	579 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	MPEG1	Q2M385	716 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	NLRP8	Q86W28	1048 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	RNF130	Q86XS8	419 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	NDNF	Q8TB73	568 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF566	Q969W8	418 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	FEV	Q99581	238 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	DUSP21	Q9H596	190 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	RLIM	Q9NVW2	624 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	MARK1	Q9P0L2	795 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152		J3KTA2	159 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152		M0QX08	132 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	TNFRSF11B	O00300	401 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	LILRB5	O75023	590 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	FGF19	O95750	216 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-222	ENST00000635152	POU2F1	P14859	743 aa		12.55	□□□□□ -0.4

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