RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 CSMD2Q7Z408 3487 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-216ENST00000628306 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 UBXN8O00124 270 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 C8GP07360 202 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 UMODP07911 640 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 IFT88Q13099 833 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 SP140Q13342 867 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP1R3AQ16821 1122 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 UNC50Q53HI1 259 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 RHBDD2Q6NTF9 364 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM73Q86UV7 250 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 AMIGO1Q86WK6 493 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 CCNYL1Q8N7R7 359 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 PHF21BQ96EK2 531 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 GSTO2Q9H4Y5 243 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 P4HTMQ9NXG6 502 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 ICKQ9UPZ9 632 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 PADI2Q9Y2J8 665 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 DOCK10Q96BY6 2186 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF195O14628 629 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 FGF4P08620 206 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 HBQ1P09105 142 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 GFAPP14136 432 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 AGXTP21549 392 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 SETDB1Q15047 1291 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP23.01■■□□□ 1.273e-9■□□□□ 10.3
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CAPNS1-216ENST00000628306 DEFB110Q30KQ9 67 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 C1orf189Q5VU69 101 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 MLIPQ5VWP3 458 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 SPESP1Q6UW49 350 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 PDPRQ8NCN5 879 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 OR2Y1Q8NGV0 311 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 ASB11Q8WXH4 323 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 IP6K3Q96PC2 410 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 MVB12BQ9H7P6 319 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC22A11Q9NSA0 550 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 DCTN4Q9UJW0 460 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 CDYLQ9Y232 598 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 AKAP9Q99996 3911 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A0G2JND7 137 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC5A10A0PJK1 596 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 C2orf74A8MZ97 194 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 SUPT3HB4E1H0 165 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 GFYI3L273 518 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 HDAC3O15379 428 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 SUPT3HO75486 399 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 RPS17P08708 135 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 GCGRP47871 477 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 AQP5P55064 265 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 PRKG2Q13237 762 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 SPNS2Q8IVW8 549 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC37BQ96QE4 947 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 OR2A14Q96R47 310 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 HGH1Q9BTY7 390 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 PNPOQ9NVS9 261 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 SPHK1Q9NYA1 384 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 NUP210LQ5VU65 1888 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 E2F3O00716 465 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 UGT2B7P16662 529 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 METTL21CQ5VZV1 264 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM91A1Q658Y4 838 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 SULT1C3Q6IMI6 304 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF781Q8N8C0 355 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 CLEC1AQ8NC01 280 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 ELMO1Q92556 727 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM54Q9BYV2 358 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 SUPT7LO94864 414 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 MATN4O95460 622 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 MLYCDO95822 493 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 CHRNGP07510 517 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 ITGAXP20702 1163 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 HSPA14Q0VDF9 509 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 GALNTL6Q49A17 601 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 EPGNQ6UW88 154 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC121Q6ZUS5 278 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 FRA10AC1Q70Z53 315 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 PROKR1Q8TCW9 393 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 PARVBQ9HBI1 364 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 CD274Q9NZQ7 290 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 STK38LQ9Y2H1 464 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 OR2B3O76000 313 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 S100BP04271 92 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
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