RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 KLHL31Q9H511 634 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 EPHA6Q9UF33 1036 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 ADAM29Q9UKF5 820 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 MAPRE3Q9UPY8 281 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A0J9YVX5 310 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 EPN2O95208 641 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 CER1O95813 267 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 STATHP02808 62 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 ST6GAL1P15907 406 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 CDH3P22223 829 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 ALDH4A1P30038 563 aa23.74■■□□□ 1.39
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CAPNS1-215ENST00000628018 UGT8Q16880 541 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 HKDC1Q2TB90 917 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 DPP10Q8N608 796 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 C16orf78Q8WTQ4 265 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 STARD8Q92502 1023 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 QRFPRQ96P65 431 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 EPB41L1Q9H4G0 881 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 MYNNQ9NPC7 610 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 C1GALT1Q9NS00 363 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 PADI4Q9UM07 663 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 H0YHG0 523 aa23.73■■□□□ 1.39
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CAPNS1-215ENST00000628018 AKAP10O43572 662 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 SYPP08247 313 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 OR1D5P58170 312 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 DPY19L1Q2PZI1 675 aa23.73■■□□□ 1.39
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CAPNS1-215ENST00000628018 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 OR4C11Q6IEV9 310 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC2A7Q6PXP3 512 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 NUDT13Q86X67 352 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2L5Q8NG80 312 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 CDC26Q8NHZ8 85 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 CLPTM1LQ96KA5 538 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 GID8Q9NWU2 228 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 CROTQ9UKG9 612 aa23.73■■□□□ 1.39
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CAPNS1-215ENST00000628018 S100A3P33764 101 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 NUBP1P53384 320 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 PSME3P61289 254 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 PHC1P78364 1004 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 FRMPD2BQ6IN97 320 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 ABHD17CQ6PCB6 329 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 PGM2L1Q6PCE3 622 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 SCUBE1Q8IWY4 988 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 ULK2Q8IYT8 1036 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM181AQ8N9Y4 354 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2I1PQ8NGU4 316 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 MAP3K3Q99759 626 aa23.72■■□□□ 1.39
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CAPNS1-215ENST00000628018 C4orf51C9J302 202 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 FXYD1O00168 92 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 B4GAT1O43505 415 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 NPPAP01160 153 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC35G6P0C7Q6 338 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 MPLP40238 635 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 PLA2G16P53816 162 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 RGS1Q08116 209 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 NKAIN2Q5VXU1 208 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM71E1Q6IPT2 247 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 CAMKMTQ7Z624 323 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 MINDY1Q8N5J2 469 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 OR7A2PQ8NGA2 310 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC58Q96CX6 371 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 OR52E6Q96RD3 313 aa23.71■■□□□ 1.39
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CAPNS1-215ENST00000628018 C17orf62Q9BQA9 187 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 PRDM7Q9NQW5 492 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 ERI3O43414 337 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 SIGLEC6O43699 453 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 HPCAL1P37235 193 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 TSFMP43897 325 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 GFERP55789 205 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 TAS2R50P59544 299 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 GPLD1P80108 840 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 NFYCQ13952 458 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 MAPKAPK3Q16644 382 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 PGS1Q32NB8 556 aa23.7■■□□□ 1.38
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