RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614197.4

NPIPB4-222, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 5 BASIC

Gene NPIPB4, Length 1,216 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-222	ENST00000614197	SNX31	Q8N9S9	440 aa		10.34	□□□□□ -0.75
NPIPB4-222	ENST00000614197	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		10.34	□□□□□ -0.75
NPIPB4-222	ENST00000614197	OR4K3	Q96R72	315 aa		10.34	□□□□□ -0.75
NPIPB4-222	ENST00000614197	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
NPIPB4-222	ENST00000614197	DERL2	Q9GZP9	239 aa		10.34	□□□□□ -0.75
NPIPB4-222	ENST00000614197	RNF32	Q9H0A6	362 aa		10.34	□□□□□ -0.75
NPIPB4-222	ENST00000614197	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
NPIPB4-222	ENST00000614197	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		10.34	□□□□□ -0.75
NPIPB4-222	ENST00000614197	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		10.34	□□□□□ -0.75
NPIPB4-222	ENST00000614197	CD274	Q9NZQ7	290 aa		10.34	□□□□□ -0.75
NPIPB4-222	ENST00000614197	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
NPIPB4-222	ENST00000614197	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
NPIPB4-222	ENST00000614197	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		10.34	□□□□□ -0.75
NPIPB4-222	ENST00000614197	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
NPIPB4-222	ENST00000614197	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	CHST10	O43529	356 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	PRMT3	O60678	531 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	PRAMEF2	O60811	474 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	SEMA7A	O75326	666 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	WDPCP	O95876	746 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	SERPINA6	P08185	405 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	CCDC166	P0CW27	439 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	CASP6	P55212	293 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	RAB8A	P61006	207 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	RBPJ	Q06330	500 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	CBLB	Q13191	982 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	NAB1	Q13506	487 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLMAP	Q14BN4	828 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	TGFBI	Q15582	683 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	MEP1A	Q16819	746 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	CYS1	Q717R9	158 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	PDSS2	Q86YH6	399 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	PPM1N	Q8N819	430 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	M1AP	Q8TC57	530 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	PSMF1	Q92530	271 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	RBBP8	Q99708	897 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	RHBG	Q9H310	441 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	RNF112	Q9ULX5	631 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	10.32	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	MED13	Q9UHV7	2174 aa		10.32	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197		A0A1B0GUH1	482 aa		10.32	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		10.32	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	CLDN4	O14493	209 aa		10.32	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	B3GALT2	O43825	422 aa		10.32	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	STK16	O75716	305 aa		10.32	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	F10	P00742	488 aa		10.32	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	CELA2A	P08217	269 aa		10.32	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	CD46	P15529	392 aa		10.32	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	CRABP2	P29373	138 aa		10.32	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	PHB	P35232	272 aa		10.32	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	MAGEA4	P43358	317 aa		10.32	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	RAB10	P61026	200 aa		10.32	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	OLR1	P78380	273 aa		10.32	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	BTN3A2	P78410	334 aa		10.32	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	LAPTM5	Q13571	262 aa		10.32	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	10.32	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	ACER2	Q5QJU3	275 aa		10.32	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	C8orf74	Q6P047	294 aa		10.32	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		10.32	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		10.32	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	CEP97	Q8IW35	865 aa		10.32	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		10.32	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		10.32	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		10.32	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	EXT2	Q93063	718 aa		10.32	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	UBE2E3	Q969T4	207 aa		10.32	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		10.32	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		10.32	□□□□□ -0.76
NPIPB4-222	ENST00000614197	MOCOS	Q96EN8	888 aa		10.32	□□□□□ -0.76

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