RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608657.5

ITGB5-212, Transcript of integrin subunit beta 5, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB5, Length 825 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5-212ENST00000608657 KCNAB1Q14722 419 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 GPR19Q15760 415 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 MMEL1Q495T6 779 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 C3orf38Q5JPI3 329 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 PGM2L1Q6PCE3 622 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 HACD2Q6Y1H2 254 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 FRMD7Q6ZUT3 714 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 RNF44Q7L0R7 432 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 PLD3Q8IV08 490 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 KRT78Q8N1N4 520 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 ABHD11Q8NFV4 315 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 SLC26A7Q8TE54 656 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 WDR34Q96EX3 536 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 LRGUKQ96M69 825 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 ZNF570Q96NI8 536 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 BTBD9Q96Q07 612 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 OR6C1Q96RD1 312 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 KLHL4Q9C0H6 718 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 FAM192AQ9GZU8 254 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 SPNS1Q9H2V7 528 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 GSTO2Q9H4Y5 243 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 ZBTB26Q9HCK0 441 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 FAM60AQ9NP50 221 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 IRAK4Q9NWZ3 460 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 OCIAD1Q9NX40 245 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 PLCL2Q9UPR0 1127 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 A0A088AWK7 358 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 TRBC2A0A5B9 178 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 VGLL3A8MV65 326 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 B4E171 279 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 TMEM150CB9EJG8 249 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 OR7A17O14581 309 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 PLD2O14939 933 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 UBDO15205 165 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 OR1F1O43749 312 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 UGDHO60701 494 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 CTSVO60911 334 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 HGFP14210 728 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 FOLR1P15328 257 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 ITGAXP20702 1163 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 ME2P23368 584 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 TSPAN7P41732 249 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 CASP2P42575 452 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 PKNOX1P55347 436 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 RELAQ04206 551 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 PCDH1Q08174 1060 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 LIPJQ5W064 366 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 GRHL2Q6ISB3 625 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 MED27Q6P2C8 311 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 MILR1Q7Z6M3 343 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 SNX32Q86XE0 403 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 GPR135Q8IZ08 494 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 DNAJC22Q8N4W6 341 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 MFSD9Q8NBP5 474 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 ICA1LQ8NDH6 482 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 OR4F6Q8NGB9 312 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 OR4K1Q8NGD4 311 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 OR52B6Q8NGF0 335 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 TSPEARQ8WU66 669 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 WDR60Q8WVS4 1066 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 UBE2E3Q969T4 207 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 ROPN1LQ96C74 230 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 REPS1Q96D71 796 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 THAP11Q96EK4 314 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 MOCOSQ96EN8 888 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 FCRL4Q96PJ5 515 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 CDK15Q96Q40 435 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 ZNF382Q96SR6 550 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 NTMT1Q9BV86 223 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 NLNQ9BYT8 704 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 MUC13Q9H3R2 512 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 MEAF6Q9HAF1 191 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 MID1IP1Q9NPA3 183 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 C8orf4Q9NR00 106 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 FGF21Q9NSA1 209 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 SLC39A1Q9NY26 324 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 NDUFA13Q9P0J0 144 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 PISDQ9UG56 409 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 TRPS1Q9UHF7 1281 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 RARRES3Q9UL19 164 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 SATB2Q9UPW6 733 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 RNF11Q9Y3C5 154 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB5-212ENST00000608657 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms