RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	PYCR2	Q96C36	320 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	OR4K3	Q96R72	315 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	PCBD2	Q9H0N5	130 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	PPT2	Q9UMR5	302 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	C4orf51	C9J302	202 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	CHST10	O43529	356 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	CEP104	O60308	925 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	B4GALT2	O60909	372 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	TSPAN12	O95859	305 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	MLN	P12872	115 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	NPPB	P16860	134 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	PGGT1B	P53609	377 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	MLF1	P58340	268 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	BTG2	P78543	158 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	HERC3	Q15034	1050 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	OLFM1	Q99784	485 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	PARVB	Q9HBI1	364 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	DNAJC13	O75165	2243 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	PRRG2	O14669	202 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	OR1F1	O43749	312 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	KRT14	P02533	472 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	C8G	P07360	202 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	ALOX12	P18054	663 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	IGFBP2	P18065	325 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	MAOA	P21397	527 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	IL10	P22301	178 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	GABRB3	P28472	473 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	CYB561	P49447	251 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	MEOX1	P50221	254 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	CDKN2D	P55273	166 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	SP140	Q13342	867 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	CD163	Q86VB7	1156 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	CYP4X1	Q8N118	509 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	RPRML	Q8N4K4	120 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	MCU	Q8NE86	351 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	OR4K1	Q8NGD4	311 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	LINGO1	Q96FE5	620 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	SARG	Q9BW04	601 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	AICDA	Q9GZX7	198 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A1B0GTH9	108 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	TRBC2	A0A5B9	178 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	HS6ST1	O60243	411 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	SERPIND1	P05546	499 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	CAPN3	P20807	821 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	JAK1	P23458	1154 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	CCND1	P24385	295 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	CDC25B	P30305	580 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	GRK3	P35626	688 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	HLCS	P50747	726 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	CCR8	P51685	355 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	TFF3	Q07654	80 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	HYAL2	Q12891	473 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	PWP1	Q13610	501 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		11.16	□□□□□ -0.62

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