RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599560.5

NUP62-216, Transcript of nucleoporin 62, human

TSL 2

Gene NUP62, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUP62-216	ENST00000599560	B4GALT2	O60909	372 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	OR6B1	O95007	311 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	METTL18	O95568	372 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	MAOA	P21397	527 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	COMT	P21964	271 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	FOXO1	Q12778	655 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	PKP4	Q99569	1192 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	GALP	Q9UBC7	116 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	HSPB2	A8KAH6	182 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	ACOT7	O00154	380 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	CLDN4	O14493	209 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	MATN4	O95460	622 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	FH	P07954	510 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	DNASE1L1	P49184	302 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	MAN2A2	P49641	1150 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	NR1H2	P55055	460 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	RELA	Q04206	551 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	PRPSAP1	Q14558	356 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	NAA25	Q14CX7	972 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	HSPB2	Q16082	182 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	WLS	Q5T9L3	541 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	BBS12	Q6ZW61	710 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	ACTL9	Q8TC94	416 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	ZNF480	Q8WV37	535 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	FAM136A	Q96C01	138 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	PIP5K1A	Q99755	562 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	P2RY12	Q9H244	342 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560		E7ENX8	843 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	MYO1C	O00159	1063 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	DVL2	O14641	736 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	CHST10	O43529	356 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	SUSD5	O60279	629 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	OR2J2	O76002	312 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	SLC16A8	O95907	504 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	TMEM253	P0C7T8	217 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	PPP2R1B	P30154	601 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	CCNF	P41002	786 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	SOX3	P41225	446 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	SSR4	P51571	173 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	PNLIPRP1	P54315	467 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	TAP2	Q03519	686 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	NR1I3	Q14994	352 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	TMED2	Q15363	201 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	ODF2	Q5BJF6	829 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	OR4L1	Q8NH43	312 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	OR1F2P	Q96R84	312 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	MED12L	Q86YW9	2145 aa		11.21	□□□□□ -0.62
NUP62-216	ENST00000599560		A0A087X1B8	175 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NUP62-216	ENST00000599560	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NUP62-216	ENST00000599560	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NUP62-216	ENST00000599560	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NUP62-216	ENST00000599560	SMAP	O00193	183 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NUP62-216	ENST00000599560	APOC2	P02655	101 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NUP62-216	ENST00000599560	BMP7	P18075	431 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NUP62-216	ENST00000599560	GPR143	P51810	404 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NUP62-216	ENST00000599560	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
NUP62-216	ENST00000599560	GBX1	Q14549	363 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NUP62-216	ENST00000599560	KCNJ11	Q14654	390 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NUP62-216	ENST00000599560	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NUP62-216	ENST00000599560	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NUP62-216	ENST00000599560	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NUP62-216	ENST00000599560	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		11.2	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms