RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588340.1

EFTUD2-210, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-210ENST00000588340 ARL15Q9NXU5 204 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 GPRC5BQ9NZH0 403 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 NUDT4Q9NZJ9 180 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 EMCNQ9ULC0 261 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 ASB1Q9Y576 335 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 POLEQ07864 2286 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 A0A1W2PQ72 361 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 CYSRT1A8MQ03 144 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 STX16O14662 325 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 P2RX6O15547 441 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 FOXS1O43638 330 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 WFS1O76024 890 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 RPS17P08708 135 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 ANXA5P08758 320 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 ACPPP15309 386 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 CD22P20273 847 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 HIST1H2ADP20671 130 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 GNLYP22749 145 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 VARSP26640 1264 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 TYK2P29597 1187 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 UQCRFS1P47985 274 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 REEP5Q00765 189 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 Q0VFX4 171 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 FAM53BQ14153 422 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 FAM83EQ2M2I3 478 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 ADPRMQ3LIE5 342 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 LGSNQ5TDP6 509 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 ATG9BQ674R7 924 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 IGFL2Q6UWQ7 119 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 Q6ZS92 163 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 TRABD2AQ86V40 505 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 GPSM1Q86YR5 675 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 PARP9Q8IXQ6 854 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 PRSS58Q8IYP2 241 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 SPATA6LQ8N4H0 392 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 ZADH2Q8N4Q0 377 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 AMER3Q8N944 861 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 TM9SF4Q92544 642 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 NEIL2Q969S2 332 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 C19orf60Q96EN9 201 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 HIST1H2AJQ99878 128 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 H2AFJQ9BTM1 129 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 YIPF2Q9BWQ6 316 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 TRIM54Q9BYV2 358 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 TGIF2Q9GZN2 237 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 LHPPQ9H008 270 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 DRC3Q9H069 523 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 ATG10Q9H0Y0 220 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 SPNS1Q9H2V7 528 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 ALG9Q9H6U8 611 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 PELI2Q9HAT8 420 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF358Q9NW07 568 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 TRPC4Q9UBN4 977 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 C3orf18Q9UK00 162 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 PPT2Q9UMR5 302 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 V9GYY5 206 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 TRBC2A0A5B9 178 aa6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 FEZF1A0PJY2 475 aa6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 SYCE1LA8MT33 242 aa6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 IDSB3KWA1 339 aa6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 TCP11X1B4DZS4 312 aa6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 I3L1I5 382 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 UBXN8O00124 270 aa6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 E2F3O00716 465 aa6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 FFAR3O14843 346 aa6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 GPR42O15529 346 aa6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 UGDHO60701 494 aa6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 STK16O75716 305 aa6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 HPP00738 406 aa6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 STATHP02808 62 aa6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 HEXBP07686 556 aa6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 RBP1P09455 135 aa6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 SMIM10L1P0DMW3 83 aa6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 SAT1P21673 171 aa6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 CXCR2P25025 360 aa6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 GSTM2P28161 218 aa6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 CRHR1P34998 444 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms