RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 UPK3BL1B0FP48 263 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRM-211ENST00000580170 UPK3BL2E5RIL1 263 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRM-211ENST00000580170 RFPL1O75677 317 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRM-211ENST00000580170 C8orf89P0DMQ9 161 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF30P17039 623 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRM-211ENST00000580170 SLC36A4Q6YBV0 504 aa20.67■□□□□ 0.9
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PTPRM-211ENST00000580170 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
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PTPRM-211ENST00000580170 ZNF33AQ06730 810 aa20.66■□□□□ 0.9
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PTPRM-211ENST00000580170 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRM-211ENST00000580170 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRM-211ENST00000580170 PAQR7Q86WK9 346 aa20.66■□□□□ 0.9
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PTPRM-211ENST00000580170 POPDC3Q9HBV1 291 aa20.66■□□□□ 0.9
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PTPRM-211ENST00000580170 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa20.66■□□□□ 0.9
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PTPRM-211ENST00000580170 MMP20O60882 483 aa20.65■□□□□ 0.9
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PTPRM-211ENST00000580170 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF81P51508 661 aa20.65■□□□□ 0.9
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PTPRM-211ENST00000580170 TUBA1CQ9BQE3 449 aa20.65■□□□□ 0.9
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PTPRM-211ENST00000580170 ZNF101Q8IZC7 436 aa20.64■□□□□ 0.9
PTPRM-211ENST00000580170 FNDC8Q8TC99 324 aa20.64■□□□□ 0.9
PTPRM-211ENST00000580170 OR2B2Q9GZK3 357 aa20.64■□□□□ 0.9
PTPRM-211ENST00000580170 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
PTPRM-211ENST00000580170 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa20.64■□□□□ 0.89
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