RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578334.5

TSPOAP1-AS1-202, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 956 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 STRA8Q7Z7C7 330 aa26.53■■□□□ 1.84
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MDS2Q8NDY4 140 aa26.53■■□□□ 1.84
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NT5CQ8TCD5 201 aa26.53■■□□□ 1.84
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CAPZA3Q96KX2 299 aa26.53■■□□□ 1.84
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HES7Q9BYE0 225 aa26.53■■□□□ 1.84
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa26.53■■□□□ 1.84
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MAN1A2O60476 641 aa26.52■■□□□ 1.84
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 B4GALT2O60909 372 aa26.52■■□□□ 1.84
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HNF4AP41235 474 aa26.52■■□□□ 1.84
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SCTRP47872 440 aa26.52■■□□□ 1.84
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SLC26A5P58743 744 aa26.52■■□□□ 1.84
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP26.52■■□□□ 1.84
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 STEAP4Q687X5 459 aa26.52■■□□□ 1.84
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LRRC39Q96DD0 335 aa26.52■■□□□ 1.84
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZFATQ9P243 1243 aa26.52■■□□□ 1.84
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TEX264Q9Y6I9 313 aa26.52■■□□□ 1.84
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ABCA12Q86UK0 2595 aa26.51■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ENO4A6NNW6 628 aa26.51■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GABRR3A8MPY1 467 aa26.51■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FAM227AF5H4B4 570 aa26.51■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CD46P15529 392 aa26.51■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 AHRP35869 848 aa26.51■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CA7P43166 264 aa26.51■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 REEP5Q00765 189 aa26.51■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DR1Q01658 176 aa26.51■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SPINK14Q6IE38 97 aa26.51■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TMPRSS11BQ86T26 416 aa26.51■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ANKMY2Q8IV38 441 aa26.51■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CYP4X1Q8N118 509 aa26.51■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CCDC120Q96HB5 630 aa26.51■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PELI2Q9HAT8 420 aa26.51■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 WISP2O76076 250 aa26.5■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CASP6P55212 293 aa26.5■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ARL4CP56559 192 aa26.5■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RAB8AP61006 207 aa26.5■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PPP1R3AQ16821 1122 aa26.5■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PTCHD1Q96NR3 888 aa26.5■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 AIF1LQ9BQI0 150 aa26.5■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CDCP1Q9H5V8 836 aa26.5■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SLC22A14Q9Y267 594 aa26.5■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PSAT1Q9Y617 370 aa26.5■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa26.49■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 URADA6NGE7 173 aa26.49■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CDC7O00311 574 aa26.49■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NDC80O14777 642 aa26.49■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SLC19A2O60779 497 aa26.49■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ITGA8P53708 1063 aa26.49■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ART3Q13508 389 aa26.49■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MTFR2Q6P444 385 aa26.49■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KIF2BQ8N4N8 673 aa26.49■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HORMAD2Q8N7B1 307 aa26.49■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ANKRD53Q8N9V6 530 aa26.49■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TMEM178AQ8NBL3 297 aa26.49■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TRPV3Q8NET8 790 aa26.49■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SCMH1Q96GD3 660 aa26.49■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RUNDC3BQ96NL0 473 aa26.49■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 EGFL8Q99944 293 aa26.49■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TRIM51Q9BSJ1 452 aa26.49■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KCNE2Q9Y6J6 123 aa26.49■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CTAGE15A4D2H0 777 aa26.48■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PRMT3O60678 531 aa26.48■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MGAT5Q09328 741 aa26.48■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZNF460Q14592 562 aa26.48■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NXPE4Q6UWF7 544 aa26.48■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MRGPRGQ86SM5 289 aa26.48■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CTAGE6Q86UF2 777 aa26.48■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LGI4Q8N135 537 aa26.48■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ELP5Q8TE02 316 aa26.48■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MAGED4Q96JG8 741 aa26.48■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SLC6A16Q9GZN6 736 aa26.48■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RHBGQ9H310 441 aa26.48■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LRFN1Q9P244 771 aa26.48■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PCNX1Q96RV3 2341 aa26.48■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa26.47■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MLYCDO95822 493 aa26.47■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PRF1P14222 555 aa26.47■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TNFRSF8P28908 595 aa26.47■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 BTG2P78543 158 aa26.47■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 QSOX2Q6ZRP7 698 aa26.47■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa26.47■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms