RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRIT2A6NDA9 550 aa31.44■■■□□ 2.62
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PIK3CBP42338 1070 aa31.44■■■□□ 2.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 AVPR1BP47901 424 aa31.44■■■□□ 2.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 UCNP55089 124 aa31.44■■■□□ 2.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC9A5Q14940 896 aa31.44■■■□□ 2.62
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ADPRMQ3LIE5 342 aa31.44■■■□□ 2.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 NIPAL1Q6NVV3 410 aa31.44■■■□□ 2.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 COX15Q7KZN9 410 aa31.44■■■□□ 2.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRSS41Q7RTY9 318 aa31.44■■■□□ 2.62
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CD63P08962 238 aa31.43■■■□□ 2.62
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CTDNEP1-209ENST00000574205 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP31.43■■■□□ 2.62
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CTDNEP1-209ENST00000574205 GAL3ST3Q96A11 431 aa31.43■■■□□ 2.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC45A3Q96JT2 553 aa31.43■■■□□ 2.62
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CTDNEP1-209ENST00000574205 OR4F21O95013 312 aa31.42■■■□□ 2.62
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SMIM10Q96HG1 83 aa31.41■■■□□ 2.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 FRG2BQ96QU4 278 aa31.41■■■□□ 2.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACTL8Q9H568 366 aa31.41■■■□□ 2.62
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CTDNEP1-209ENST00000574205 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP31.4■■■□□ 2.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 SASH3O75995 380 aa31.4■■■□□ 2.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 KLHL18O94889 574 aa31.4■■■□□ 2.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 ESRRBO95718 433 aa31.4■■■□□ 2.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 SERPINB4P48594 390 aa31.4■■■□□ 2.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 DEFB134Q4QY38 66 aa31.4■■■□□ 2.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 PDSS2Q86YH6 399 aa31.4■■■□□ 2.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR2L5Q8NG80 312 aa31.4■■■□□ 2.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 AGAP11Q8TF27 550 aa31.4■■■□□ 2.62
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