RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561951.5

BBS2-204, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, human

TSL 3

Gene BBS2, Length 845 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS2-204	ENST00000561951	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	WHRN	Q9P202	907 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	SLC22A7	Q9Y694	548 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	B4GALT2	O60909	372 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	FH	P07954	510 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	CYC1	P08574	325 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	ICAM2	P13598	275 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	JAK1	P23458	1154 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	GDF5	P43026	501 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	POU4F1	Q01851	419 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	NSDHL	Q15738	373 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	11.13	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	BEST3	Q8N1M1	668 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	BCORP1	Q8N888	145 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	NT5C	Q8TCD5	201 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	FAR1	Q8WVX9	515 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	OR1F2P	Q96R84	312 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	RBBP8	Q99708	897 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	KCNK13	Q9HB14	408 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951		A0A0G2JN53	185 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	OR5H15	A6NDH6	313 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	C4orf51	C9J302	202 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	11.12	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	CHST10	O43529	356 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	DNAJB6	O75190	326 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	CCDC166	P0CW27	439 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	EDN3	P14138	238 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	STMN1	P16949	149 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	GNAZ	P19086	355 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	AHR	P35869	848 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	GP5	P40197	560 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	HNMT	P50135	292 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	PLTP	P55058	493 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	OR4D2	P58180	307 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	CDKL1	Q00532	357 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	PMP22	Q01453	160 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	RHAG	Q02094	409 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	11.12	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	11.12	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	CYP4X1	Q8N118	509 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	PPM1N	Q8N819	430 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	SNX31	Q8N9S9	440 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	TRPV3	Q8NET8	790 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	ANKRD7	Q92527	254 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	LPAR4	Q99677	370 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	CPNE1	Q99829	537 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	SARG	Q9BW04	601 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	DERL2	Q9GZP9	239 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	RAB17	Q9H0T7	212 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	LANCL2	Q9NS86	450 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	ABI3	Q9P2A4	366 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	URAD	A6NGE7	173 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	FAM159B	A6NKW6	160 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	CLGN	O14967	610 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	DDAH2	O95865	285 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	LDLR	P01130	860 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	MAOA	P21397	527 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	IL10	P22301	178 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	GMPR	P36959	345 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	SLC6A12	P48065	614 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	HSPA7	P48741	367 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	KCNK10	P57789	538 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	TGFBI	Q15582	683 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	OR4D1	Q15615	310 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	INA	Q16352	499 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS2-204	ENST00000561951	EXT1	Q16394	746 aa		11.11	□□□□□ -0.63

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