RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	LSMEM2	Q8N112	164 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	GPATCH11	Q8N954	259 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	AVL9	Q8NBF6	648 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	GPR150	Q8NGU9	434 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	HM13	Q8TCT9	377 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	FGF11	Q92914	225 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	ART4	Q93070	314 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	NXPE2	Q96DL1	559 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	FOPNL	Q96NB1	174 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	PANX3	Q96QZ0	392 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	ERP44	Q9BS26	406 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	HGH1	Q9BTY7	390 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	CARD6	Q9BX69	1037 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	RAB17	Q9H0T7	212 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	COG4	Q9H9E3	785 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	TREX1	Q9NSU2	369 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	SMOX	Q9NWM0	555 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	CACNA1B	Q00975	2339 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	AGAP14	A8MT82	685 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	AHRR	A9YTQ3	701 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	DIRC3	C9JPN6	131 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	KLK10	O43240	276 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	PRAMEF10	O60809	474 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	VPS26A	O75436	327 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	PIAS1	O75925	651 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	USP1	O94782	785 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	TUBB4A	P04350	444 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	TNFRSF1A	P19438	455 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC6A2	P23975	617 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	MCM3	P25205	808 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	IVD	P26440	423 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	NDUFS1	P28331	727 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	SSTR1	P30872	391 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC5A2	P31639	672 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	ETV5	P41161	510 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC1A2	P43004	574 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	MAGEA6	P43360	314 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	FASLG	P48023	281 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC12A2	P55011	1212 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	GFER	P55789	205 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	MPP1	Q00013	466 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC25A3	Q00325	362 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	CFHR1	Q03591	330 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	DMPK	Q09013	629 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	CUL1	Q13616	776 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	TUBA3C	Q13748	450 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	OOSP2	Q86WS3	158 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	LRRC6	Q86X45	466 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	VRK3	Q8IV63	474 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		4.49	□□□□□ -1.69

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