RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551592.5

SENP1-208, Transcript of SUMO specific peptidase 1, human

TSL 3

Gene SENP1, Length 866 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SENP1-208	ENST00000551592	ABCG4	Q9H172	646 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	EXOC1	Q9NV70	894 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	PANK4	Q9NVE7	773 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592		A0A1B0GUV1	79 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	ZNF732	B4DXR9	585 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	FPGT	O14772	594 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	SYT7	O43581	403 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	HSF2BP	O75031	334 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	OR6B1	O95007	311 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	NTN1	O95631	604 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	GHR	P10912	638 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	ZNF18	P17022	549 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	OR1D2	P34982	312 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	ASMT	P46597	345 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	TNFSF10	P50591	281 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	STX1A	Q16623	288 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	ADCK1	Q86TW2	530 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	OR1L3	Q8NH93	324 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	SEPT8	Q92599	483 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	ESAM	Q96AP7	390 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	NXPE2	Q96DL1	559 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	C14orf79	Q96F83	325 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	SNURFL	B1AK76	121 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	MLNR	O43193	412 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	GUCA1C	O95843	209 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	GAS8	O95995	478 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	MT-ND2	P03891	347 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	CHRNG	P07510	517 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	ODC1	P11926	461 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	B4GALT1	P15291	398 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	ITGA3	P26006	1051 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	MAGEA11	P43364	429 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	HSD17B7	P56937	341 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	GPR50	Q13585	617 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	TRIM29	Q14134	588 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	GIT2	Q14161	759 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	RNF149	Q8NC42	400 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	TRPV3	Q8NET8	790 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	OR4C3	Q8NH37	302 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	OR4A16	Q8NH70	328 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	C10orf90	Q96M02	699 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	SIX2	Q9NPC8	291 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	ZFP57	Q9NU63	452 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	NUDC	Q9Y266	331 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	ATP6AP2	A0A1C7CYW4	349 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	MSGN1	A6NI15	193 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	CHUK	O15111	745 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SENP1-208	ENST00000551592	EPHB6	O15197	1021 aa		4.51	□□□□□ -1.69

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