RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542667.5

TM7SF3-211, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 3

Gene TM7SF3, Length 613 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-211ENST00000542667 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa13.53□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa13.53□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 TTLL8A6PVC2 850 aa13.53□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 FAM227AF5H4B4 570 aa13.53□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 CHST10O43529 356 aa13.53□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 KERAO60938 352 aa13.53□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 SH3BGRLO75368 114 aa13.53□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 WISP1O95388 367 aa13.53□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 HPP00738 406 aa13.53□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 F10P00742 488 aa13.53□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 MTHFD2P13995 350 aa13.53□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 ALOX12P18054 663 aa13.53□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 AHRP35869 848 aa13.53□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 RGS1Q08116 209 aa13.53□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 PWP1Q13610 501 aa13.53□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 PCOLCEQ15113 449 aa13.53□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 PDK4Q16654 411 aa13.53□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 SLC6A19Q695T7 634 aa13.53□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa13.53□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 TCAIMQ8N3R3 496 aa13.53□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 RNF175Q8N4F7 328 aa13.53□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 TBC1D19Q8N5T2 526 aa13.53□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 SIRT6Q8N6T7 355 aa13.53□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 DCAKDQ8WVC6 231 aa13.53□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 TSLPQ969D9 159 aa13.53□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 GPR78Q96P69 363 aa13.53□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 FUT8Q9BYC5 575 aa13.53□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 SLC6A16Q9GZN6 736 aa13.53□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 C14orf105Q9NVL8 296 aa13.53□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 NUDT4Q9NZJ9 180 aa13.53□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 SLC22A7Q9Y694 548 aa13.53□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 FLNCQ14315 2725 aa13.53□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 DPM1O60762 260 aa13.52□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 B4GALT2O60909 372 aa13.52□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 INHBAP08476 426 aa13.52□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 C8orf89P0DMQ9 161 aa13.52□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 MYBL2P10244 700 aa13.52□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 CXCR2P25025 360 aa13.52□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 GCAP28676 217 aa13.52□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 MSH2P43246 934 aa13.52□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 SERPINB8P50452 374 aa13.52□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 BTN3A2P78410 334 aa13.52□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 BTG2P78543 158 aa13.52□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 CHIT1Q13231 466 aa13.52□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 HERC3Q15034 1050 aa13.52□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 PFKFB4Q16877 469 aa13.52□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 FAM219BQ5XKK7 198 aa13.52□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 TMEM205Q6UW68 189 aa13.52□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 CEP128Q6ZU80 1094 aa13.52□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 NDUFAF7Q7L592 441 aa13.52□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 IFT20Q8IY31 132 aa13.52□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 C19orf60Q96EN9 201 aa13.52□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 FAM129AQ9BZQ8 928 aa13.52□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 LHPPQ9H008 270 aa13.52□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 LANCL2Q9NS86 450 aa13.52□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 PTGFRNQ9P2B2 879 aa13.52□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 MAP10Q9P2G4 905 aa13.52□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 TRIM49D1C9J1S8 452 aa13.51□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 KLHL2O95198 593 aa13.51□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 PRR35P0CG20 571 aa13.51□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 SMIM10L1P0DMW3 83 aa13.51□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 ITGAMP11215 1152 aa13.51□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 PLA2G16P53816 162 aa13.51□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 SOX8P57073 446 aa13.51□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 FOXK1P85037 733 aa13.51□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 RHAGQ02094 409 aa13.51□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 IRF8Q02556 426 aa13.51□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 KCNC4Q03721 635 aa13.51□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 FAM83EQ2M2I3 478 aa13.51□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 ABHD13Q7L211 337 aa13.51□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 ANKRD37Q7Z713 158 aa13.51□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 KBTBD2Q8IY47 623 aa13.51□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 TEX9Q8N6V9 391 aa13.51□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 CATSPER1Q8NEC5 780 aa13.51□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 TRPV3Q8NET8 790 aa13.51□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 METTL21AQ8WXB1 218 aa13.51□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 NACC2Q96BF6 587 aa13.51□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 SMIM10Q96HG1 83 aa13.51□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 ZNF700Q9H0M5 742 aa13.51□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 TSPYL1Q9H0U9 437 aa13.51□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 PRM3Q9NNZ6 103 aa13.51□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 PLA2G3Q9NZ20 509 aa13.51□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 GPRC5BQ9NZH0 403 aa13.51□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 IKBKGQ9Y6K9 419 aa13.51□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 MYO18BQ8IUG5 2567 aa13.51□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa13.5□□□□□ -0.25
TM7SF3-211ENST00000542667 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 144.9 ms