RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541869.5

POLR1B-217, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene POLR1B, Length 5,059 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-217ENST00000541869 CYP27C1Q4G0S4 372 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 SLC25A24Q6NUK1 477 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 OR6Y1Q8NGX8 325 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 CHFRQ96EP1 664 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 CNBD2Q96M20 576 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 RDH14Q9HBH5 336 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 SERHLQ9NQF3 203 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 CLN6Q9NWW5 311 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 ACTR10Q9NZ32 417 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 ABCA3Q99758 1704 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 DNAJA2O60884 412 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 BMP1P13497 986 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 BICRALQ6AI39 1079 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 HSDL2Q6YN16 418 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 NLGN4XQ8N0W4 816 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 PDPRQ8NCN5 879 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 PEX11GQ96HA9 241 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 DOHHQ9BU89 302 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 SP140LQ9H930 580 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 TMEM184CQ9NVA4 438 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 CEP290O15078 2479 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 ARHGEF33A8MVX0 844 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 FTCDNL1E5RQL4 147 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 WDPCPO95876 746 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 BPIP17213 487 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 AQP1P29972 269 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 PTPRCAPQ14761 206 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 DEFB110Q30KQ9 67 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 GFOD2Q3B7J2 385 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 OR4C15Q8NGM1 316 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 ZFPM2Q8WW38 1151 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 RCN3Q96D15 328 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 THAP11Q96EK4 314 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 PPM1MQ96MI6 270 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 CD180Q99467 661 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 ZPBPQ9BS86 351 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 CD244Q9BZW8 370 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 RASSF1Q9NS23 344 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 PDE5AO76074 875 aa9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 RETP07949 1114 aa9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 HLA-FP30511 346 aa9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 ARFIP1P53367 373 aa9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 ID2Q02363 134 aa9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 NKD1Q969G9 470 aa9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 C7orf26Q96N11 449 aa9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 CAMK1GQ96NX5 476 aa9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 GPR22Q99680 433 aa9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 PCED1AQ9H1Q7 454 aa9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 PRSS16Q9NQE7 514 aa9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 PGM3O95394 542 aa9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 MSL3P1P0C860 447 aa9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 CLCN2P51788 898 aa9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF311Q5JNZ3 666 aa9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 DHRSXQ8N5I4 330 aa9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 HSD3B7Q9H2F3 369 aa9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 EPHX3Q9H6B9 360 aa9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 DKK3Q9UBP4 350 aa9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 TIAM2Q8IVF5 1701 aa9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 FAM159BA6NKW6 160 aa9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 LOC730098B7Z3J9 87 aa9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 GNB5O14775 395 aa9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 CLOCKO15516 846 aa9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 ACADSP16219 412 aa9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 GDF1P27539 372 aa9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 OR52E8Q6IFG1 317 aa9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 PNCKQ6P2M8 343 aa9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 GPAT4Q86UL3 456 aa9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 GPR137CQ8N3F9 429 aa9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 OR4C6Q8NH72 309 aa9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 TIMM29Q9BSF4 260 aa9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 RGS5O15539 181 aa9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 PRAMEF12O95522 483 aa9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 AVPR2P30518 371 aa9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 ERVK-8P63133 956 aa9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 DCDP81605 110 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 CBX3Q13185 183 aa9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 TSPAN33Q86UF1 283 aa9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 SFRP1Q8N474 314 aa9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 TSPAN14Q8NG11 270 aa9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.5 ms