RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 DYDC1Q8WWB3 177 aa17.8■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 SELENOMQ8WWX9 145 aa17.8■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 GBP5Q96PP8 586 aa17.8■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 ROGDIQ9GZN7 287 aa17.8■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 ANKHQ9HCJ1 492 aa17.8■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 NUP210LQ5VU65 1888 aa17.8■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 CEP295Q9C0D2 2601 aa17.8■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa17.8■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 SCN3AQ9NY46 2000 aa17.79■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 LRIT2A6NDA9 550 aa17.79■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 H0YIG0 161 aa17.79■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 MEN1O00255 615 aa17.79■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 FFAR3O14843 346 aa17.79■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 GPR42O15529 346 aa17.79■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 RAD1O60671 282 aa17.79■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 ULK1O75385 1050 aa17.79■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 CD63P08962 238 aa17.79■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 ALOX12P18054 663 aa17.79■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 BGNP21810 368 aa17.79■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 DCDP81605 110 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 HYAL2Q12891 473 aa17.79■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 STX3Q13277 289 aa17.79■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 DTX1Q86Y01 620 aa17.79■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa17.79■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 KCT2Q8NC54 265 aa17.79■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF248Q8NDW4 579 aa17.79■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 SERPINI1Q99574 410 aa17.79■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 NDOR1Q9UHB4 597 aa17.79■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 PADI1Q9ULC6 663 aa17.79■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 SERTM1A2A2V5 107 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 AZIN1O14977 448 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 SEMA3DO95025 777 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 ONECUT2O95948 504 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 GALNT6Q8NCL4 622 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 FKBP10Q96AY3 582 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 MS4A6EQ96DS6 147 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 FAR2Q96K12 515 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 KCNC2Q96PR1 638 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 MANSC1Q9H8J5 431 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 LHX9Q9NQ69 397 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 PFDN4Q9NQP4 134 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 RAP2CQ9Y3L5 183 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 MAGEB17A8MXT2 336 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 C9J4A7 227 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 MANBAO00462 879 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 CHRNGP07510 517 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 ALAS2P22557 587 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 SLC1A6P48664 564 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 BST1Q10588 318 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 KANK2Q63ZY3 851 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 ADNP2Q6IQ32 1131 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 CLYBLQ8N0X4 340 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 SLC38A9Q8NBW4 561 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 MDM1Q8TC05 714 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 CCT7Q99832 543 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF304Q9HCX3 659 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 THAP1Q9NVV9 213 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 HAO1Q9UJM8 370 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 ERI3O43414 337 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 STAT5AP42229 794 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 CCR10P46092 362 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 RAP1GDS1P52306 607 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 RPS13P62277 151 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 DSG2Q14126 1118 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 SH2D4BQ5SQS7 431 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 DEPDC1Q5TB30 811 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 ZFAND4Q86XD8 727 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 TBCDQ9BTW9 1192 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 EFHD1Q9BUP0 239 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 DPH1Q9BZG8 443 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 AKAP13Q12802 2813 aa17.77■□□□□ 0.43
PTPRK-218ENST00000525459 C21orf140B9A014 251 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRK-218ENST00000525459 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
PTPRK-218ENST00000525459 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
PTPRK-218ENST00000525459 TGFB1P01137 390 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRK-218ENST00000525459 PDYNP01213 254 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRK-218ENST00000525459 ALBP02768 609 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRK-218ENST00000525459 STATHP02808 62 aa17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.9 ms