RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516577.1

RNU6-1018P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1018, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1018P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CAMPP49913 170 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MAPK12P53778 367 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PEX3P56589 373 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TMF1P82094 1093 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 VEZF1Q14119 521 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MPPED2Q15777 294 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CCDC14Q49A88 953 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 JADE1Q6IE81 842 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OR4A47Q6IF82 309 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC25A34Q6PIV7 304 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OR5M9Q8NGP3 310 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ETNPPLQ8TBG4 499 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ST8SIA4Q92187 359 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MTMR12Q9C0I1 747 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KCNK15Q9H427 330 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 Q9H8V8 135 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HPS4Q9NQG7 708 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TAGLN3Q9UI15 199 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HACL1Q9UJ83 578 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KLHL21Q9UJP4 597 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MGAT4AQ9UM21 535 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GPR52Q9Y2T5 361 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KCNE2Q9Y6J6 123 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ASTN1O14525 1302 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 A8MX80 341 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 O00370 1275 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FBP2O00757 339 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GPAA1O43292 621 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 BAIAP3O94812 1187 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TOMM70O94826 608 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IGHV2-70P01814 119 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 UGT1A6P19224 532 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FCGR2CP31995 323 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DUTP33316 252 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GRK6P43250 576 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MAGEA9P43362 315 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC9A3P48764 834 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CAV2P51636 162 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF136P52737 540 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RIPPLY3P57055 190 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KLC1Q07866 573 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OPCMLQ14982 345 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CYB5R2Q6BCY4 276 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RCOR2Q8IZ40 523 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF615Q8N8J6 731 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF709Q8N972 641 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OR13F1Q8NGS4 319 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF671Q8TAW3 534 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF596Q8TC21 504 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HTRA1Q92743 480 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CASP10Q92851 521 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GLT8D2Q9H1C3 349 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 UBQLN3Q9H347 655 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KCNK13Q9HB14 408 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DPP3Q9NY33 737 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TAS2R10Q9NYW0 307 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MTMR6Q9Y217 621 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PADI2Q9Y2J8 665 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LTBP4Q8N2S1 1624 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NEMP2A6NFY4 417 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CASTOR2A6NHX0 329 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SCAMP1O15126 338 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GPX5O75715 221 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OR2C1O95371 312 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DANCRP0C864 163 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GABRB1P18505 474 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CELP19835 753 aa0.04□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.4 ms