RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513284.5

RNF4-218, Transcript of ring finger protein 4, human

TSL 4

Gene RNF4, Length 517 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF4-218	ENST00000513284	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	P2RY12	Q9H244	342 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	TAC3	Q9UHF0	121 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284		A0A0G2JMM0	328 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284		A0A1B0GVC2	190 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284		A0A1W2PPB8	328 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284		A0A1W2PRS3	328 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284		H7BY64	318 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	AP3B1	O00203	1094 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	RDH16	O75452	317 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	IGHG3	P01860	377 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	ADRA1D	P25100	572 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	CCNF	P41002	786 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	GBX1	Q14549	363 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	NAA25	Q14CX7	972 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	TRIL	Q7L0X0	811 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	KCT2	Q8NC54	265 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	ALG3	Q92685	438 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	PKP4	Q99569	1192 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	GALP	Q9UBC7	116 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	OR14I1	A6ND48	311 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	FAM166B	A8MTA8	275 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284		E7ENX8	843 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	MYO1C	O00159	1063 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	BCKDK	O14874	412 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	KPNA5	O15131	536 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	PFDN6	O15212	129 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	EPX	P11678	715 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	BTG2	P78543	158 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	TAP2	Q03519	686 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	AADACL2	Q6P093	401 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	PAOX	Q6QHF9	649 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	CYP4Z2P	Q8N1L4	340 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	NAXE	Q8NCW5	288 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	LINC01560	Q8TB33	94 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	FOPNL	Q96NB1	174 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	SMC6	Q96SB8	1091 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	B3GALT4	O96024	378 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	IFNB1	P01574	187 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	CELA3A	P09093	270 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	TACR1	P25103	407 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	GRIA1	P42261	906 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	TTPA	P49638	278 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	PNLIPRP1	P54315	467 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	10.4	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	XKR6	Q5GH73	641 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	CYP4X1	Q8N118	509 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	CCDC89	Q8N998	374 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	OR2M7	Q8NG81	312 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	ZNF480	Q8WV37	535 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	SARG	Q9BW04	601 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RNF4-218	ENST00000513284	DEFB126	Q9BYW3	111 aa		10.4	□□□□□ -0.74

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