RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497268.1

ZEB2-223, Transcript of zinc finger E-box binding homeobox 2, human

TSL 3

Gene ZEB2, Length 674 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZEB2-223	ENST00000497268	PDE1A	P54750	535 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	ACTR2	P61160	394 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	ARF6	P62330	175 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	PRKAA1	Q13131	559 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	BAMBI	Q13145	260 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	PLA1A	Q53H76	456 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	DCST1	Q5T197	706 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	DDI2	Q5TDH0	399 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	CARD17	Q5XLA6	110 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268		Q6ZVL8	140 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	USP43	Q70EL4	1123 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	ZNF573	Q86YE8	665 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	HPS6	Q86YV9	775 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	CDK20	Q8IZL9	346 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	SFRP1	Q8N474	314 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	TMEM104	Q8NE00	496 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	COA7	Q96BR5	231 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	RNFT2	Q96EX2	444 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	MARK4	Q96L34	752 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	TAAR6	Q96RI8	345 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	METTL9	Q9H1A3	318 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	MMP27	Q9H306	513 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	RGCC	Q9H4X1	137 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	ECT2	Q9H8V3	914 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	LANCL2	Q9NS86	450 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	TREX1	Q9NSU2	369 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	SETD4	Q9NVD3	440 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	SCOC	Q9UIL1	159 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	GABRQ	Q9UN88	632 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	NFS1	Q9Y697	457 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	NAIP	Q13075	1403 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	LRRC37A3	O60309	1634 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	TECPR2	O15040	1411 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	NUP155	O75694	1391 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268		A0A087WZY1	265 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268		A0A0U1RQJ8	604 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	URAD	A6NGE7	173 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	GLOD5	A6NK44	160 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	LRRN3	E7EW58	273 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	PLK4	O00444	970 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	CST8	O60676	142 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	B4GALT2	O60909	372 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	IFNA6	P05013	189 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	ITGA5	P08648	1049 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	CD3G	P09693	182 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	CTXN2	P0C2S0	81 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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