RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496332.5

THBS3-208, Transcript of thrombospondin 3, human

TSL 3

Gene THBS3, Length 839 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
THBS3-208	ENST00000496332	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	UQCRH	P07919	91 aa		11.16	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	ITGAM	P11215	1152 aa		11.16	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	GGT5	P36269	586 aa		11.16	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	GMPR	P36959	345 aa		11.16	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	HSPA7	P48741	367 aa		11.16	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	AP2B1	P63010	937 aa		11.16	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	SKP1	P63208	163 aa		11.16	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	ARG2	P78540	354 aa		11.16	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	RHAG	Q02094	409 aa		11.16	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	HYAL2	Q12891	473 aa		11.16	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	CDC16	Q13042	620 aa		11.16	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	NAB1	Q13506	487 aa		11.16	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	11.16	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	TLR1	Q15399	786 aa		11.16	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		11.16	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		11.16	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		11.16	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		11.16	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	RAPH1	Q70E73	1250 aa		11.16	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		11.16	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		11.16	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		11.16	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		11.16	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	KIAA1191	Q96A73	305 aa		11.16	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	ESAM	Q96AP7	390 aa		11.16	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	OR1F2P	Q96R84	312 aa		11.16	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		11.16	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		11.16	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	KLHL31	Q9H511	634 aa		11.16	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		11.16	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	WWOX	Q9NZC7	414 aa		11.16	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		11.16	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	CD274	Q9NZQ7	290 aa		11.16	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	RNF112	Q9ULX5	631 aa		11.16	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		11.16	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	DYTN	A2CJ06	578 aa		11.15	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	CLGN	O14967	610 aa		11.15	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	STK16	O75716	305 aa		11.15	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	FH	P07954	510 aa		11.15	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	SERPINA6	P08185	405 aa		11.15	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		11.15	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		11.15	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	CRABP2	P29373	138 aa		11.15	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	KCNC1	P48547	511 aa		11.15	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	AGTR2	P50052	363 aa		11.15	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	DLG1	Q12959	904 aa		11.15	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	11.15	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		11.15	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	NR6A1	Q15406	480 aa		11.15	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	NSDHL	Q15738	373 aa		11.15	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	BTBD16	Q32M84	506 aa		11.15	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		11.15	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	FHL5	Q5TD97	284 aa		11.15	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		11.15	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	11.15	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		11.15	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	SNX31	Q8N9S9	440 aa		11.15	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	PDPR	Q8NCN5	879 aa		11.15	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		11.15	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		11.15	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	EXT2	Q93063	718 aa		11.15	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		11.15	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	SMIM10	Q96HG1	83 aa		11.15	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	AICDA	Q9GZX7	198 aa		11.15	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	ALG9	Q9H6U8	611 aa		11.15	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		11.15	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		11.15	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	LRRK2	Q5S007	2527 aa		11.14	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332		A8MUI8	341 aa		11.14	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		11.14	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	C4orf51	C9J302	202 aa		11.14	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	B4GALT2	O60909	372 aa		11.14	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	AGFG2	O95081	481 aa		11.14	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	CBX6	O95503	412 aa		11.14	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	F10	P00742	488 aa		11.14	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	TFEB	P19484	476 aa		11.14	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	JAK1	P23458	1154 aa		11.14	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	TNFSF10	P50591	281 aa		11.14	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	STXBP1	P61764	594 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	PDK4	Q16654	411 aa		11.14	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	SFT2D3	Q587I9	215 aa		11.14	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	XKR6	Q5GH73	641 aa		11.14	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	MROH9	Q5TGP6	573 aa		11.14	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		11.14	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	ISCA2	Q86U28	154 aa		11.14	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	KRT78	Q8N1N4	520 aa		11.14	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	TTL	Q8NG68	377 aa		11.14	□□□□□ -0.63

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