RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	LCA5	Q86VQ0	697 aa		16.35	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		16.35	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	16.35	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		16.35	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		16.35	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	16.35	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		16.35	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		16.35	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	HAS2	Q92819	552 aa		16.35	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	NXNL1	Q96CM4	212 aa		16.35	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	16.35	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	16.35	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	SCYL1	Q96KG9	808 aa		16.35	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	MFRP	Q9BY79	579 aa		16.35	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	ALG9	Q9H6U8	611 aa		16.35	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		16.35	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	WWOX	Q9NZC7	414 aa		16.35	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	16.35	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		16.35	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB21	Q9UL25	225 aa		16.35	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	TMCO1	Q9UM00	188 aa		16.35	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		16.35	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	16.35	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		16.35	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		16.35	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	RELN	P78509	3460 aa		16.35	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		16.34	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	16.34	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	16.34	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		16.34	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	16.34	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	KERA	O60938	352 aa		16.34	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	CDH16	O75309	829 aa		16.34	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	ALOX12B	O75342	701 aa		16.34	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	SUPT3H	O75486	399 aa		16.34	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	DDAH2	O95865	285 aa		16.34	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	PRR35	P0CG20	571 aa		16.34	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	16.34	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	KRT15	P19012	456 aa		16.34	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	SOX11	P35716	441 aa		16.34	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	16.34	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	16.34	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424		Q0VFX4	171 aa		16.34	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	INA	Q16352	499 aa		16.34	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		16.34	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	ISCA2	Q86U28	154 aa		16.34	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	TDRP	Q86YL5	185 aa		16.34	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	PLD3	Q8IV08	490 aa		16.34	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		16.34	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		16.34	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		16.34	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	TRPV3	Q8NET8	790 aa		16.34	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		16.34	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	NT5C	Q8TCD5	201 aa		16.34	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		16.34	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		16.34	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	ISL2	Q96A47	359 aa		16.34	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		16.34	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	16.34	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		16.34	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	TBK1	Q9UHD2	729 aa		16.34	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		16.34	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		16.34	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	ESPL1	Q14674	2120 aa		16.34	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		16.33	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	CDH1	P12830	882 aa		16.33	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	OR4D1	Q15615	310 aa		16.33	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	16.33	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	16.33	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	TTL	Q8NG68	377 aa		16.33	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		16.33	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		16.33	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		16.33	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	PSMF1	Q92530	271 aa		16.33	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	EXT2	Q93063	718 aa		16.33	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		16.33	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		16.33	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	OR4K3	Q96R72	315 aa		16.33	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		16.33	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	16.33	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		16.33	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	16.33	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		16.33	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		16.33	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	COPG2	Q9UBF2	871 aa		16.33	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		16.33	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	16.33	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	COL12A1	Q99715	3063 aa		16.33	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	TLDC2	A0PJX2	215 aa		16.32	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	DYTN	A2CJ06	578 aa		16.32	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	SMIM23	A6NLE4	172 aa		16.32	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		16.32	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	16.32	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	WFS1	O76024	890 aa		16.32	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	WDR47	O94967	919 aa		16.32	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	CBX6	O95503	412 aa		16.32	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	NUDT17	P0C025	328 aa		16.32	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	GFAP	P14136	432 aa		16.32	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	16.32	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	GGT5	P36269	586 aa		16.32	■□□□□ 0.2

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