RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474246.1

SMARCE1-208, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMARCE1, Length 2,124 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-208ENST00000474246 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 FBN2P35556 2912 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 MGAT4DA6NG13 374 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 H7C4K7 107 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 WNT10BO00744 389 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 HSPA12AO43301 675 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 LANCL1O43813 399 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 KLK8O60259 260 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 HSF2BPO75031 334 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 LRCH4O75427 683 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 LEFTY1O75610 366 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 SEC14L2O76054 403 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 PRB1P04280 392 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 IL12BP29460 328 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 SERPINB5P36952 375 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 NAMPTP43490 491 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 OMPP47874 163 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 TGM4P49221 684 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 SOX8P57073 446 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 MTAPQ13126 283 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 LSAMPQ13449 338 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 LRRC14Q15048 493 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 ZNF789Q5FWF6 425 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 CT83Q5H943 113 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 DDI2Q5TDH0 399 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 GPR157Q5UAW9 335 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 ALS2CLQ60I27 953 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 KCTD16Q68DU8 428 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 LRRC8BQ6P9F7 803 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 PGAP1Q75T13 922 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 SLC35D2Q76EJ3 337 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 NIPA1Q7RTP0 329 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 GDF7Q7Z4P5 450 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 FBXO11Q86XK2 927 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 C17orf78Q8N4C9 275 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 VGLL2Q8N8G2 317 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 OR10H4Q8NGA5 316 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 KAT5Q92993 513 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 MARC2Q969Z3 335 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 MEGF10Q96KG7 1140 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 CCDC140Q96MF4 163 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 ZIM3Q96PE6 472 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 TMEM246Q9BRR3 403 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 NAT9Q9BTE0 207 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 IL22Q9GZX6 179 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 XYLT2Q9H1B5 865 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 CHST11Q9NPF2 352 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 ERAP1Q9NZ08 941 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 CRLS1Q9UJA2 301 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 MKLN1Q9UL63 735 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 TBC1D24Q9ULP9 559 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 FKBP7Q9Y680 259 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 LRRC37AA6NMS7 1700 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 DUOX1Q9NRD9 1551 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 DNAH14Q0VDD8 3507 aa5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 EPOPA6NHQ4 379 aa5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 OR2AT4A6NND4 320 aa5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 QSOX1O00391 747 aa5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 ADAMDEC1O15204 470 aa5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 ZNF208O43345 1280 aa5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 CLEC3AO75596 197 aa5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 RNF224P0DH78 156 aa5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 SAGP10523 405 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 PLS3P13797 630 aa5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 MYL6BP14649 208 aa5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 ACPPP15309 386 aa5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 F8A1P23610 371 aa5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 ACVR2AP27037 513 aa5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 KCNJ3P48549 501 aa5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 KLF10Q13118 480 aa5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 DUSP8Q13202 625 aa5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 IL10RAQ13651 578 aa5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 EMC2Q15006 297 aa5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 ZNF174Q15697 407 aa5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 UGT8Q16880 541 aa5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 GXYLT1Q4G148 440 aa5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-208ENST00000474246 C20orf194Q5TEA3 1177 aa5.84□□□□□ -1.47
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