RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 AHRP35869 848 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 HNMTP50135 292 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 RAB8AP61006 207 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 BTG2P78543 158 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 RHAGQ02094 409 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 E2F2Q14209 437 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC29A2Q14542 456 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 PCOLCEQ15113 449 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 IGFBP7Q16270 282 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 CDKL4Q5MAI5 379 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 TEX35Q5T0J7 233 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM205Q6UW68 189 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 ASB18Q6ZVZ8 466 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 MED25Q71SY5 747 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 UBE3DQ7Z6J8 389 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 RAB43Q86YS6 212 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 IFT20Q8IY31 132 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 CYP4X1Q8N118 509 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 SNX31Q8N9S9 440 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 Q8NA96 180 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM52Q8NDY8 209 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 STAG3L4Q8TBR4 150 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 MZB1Q8WU39 189 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 PSMF1Q92530 271 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 TSLPQ969D9 159 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 WDR34Q96EX3 536 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 MVB12AQ96EY5 273 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 QRFPRQ96P65 431 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 C17orf62Q9BQA9 187 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 AIF1LQ9BQI0 150 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 CRB3Q9BUF7 120 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 VN1R1Q9GZP7 353 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 EPN3Q9H201 632 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 VPS11Q9H270 941 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 NMRAL1Q9HBL8 299 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 ZBTB26Q9HCK0 441 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 LANCL2Q9NS86 450 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 NUDT4Q9NZJ9 180 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 LUZP4Q9P127 313 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 COPG2Q9UBF2 871 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 ZFP69BQ9UJL9 534 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 PADI2Q9Y2J8 665 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 KCNE2Q9Y6J6 123 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 NINQ8N4C6 2090 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A087X1B8 175 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1W2PPM1 405 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 LRIT2A6NDA9 550 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 TGFBR3LH3BV60 316 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 PPP6CO00743 305 aa6.61□□□□□ -1.35
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RABGEF1-206ENST00000461017 SLC28A2O43868 658 aa6.61□□□□□ -1.35
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RABGEF1-206ENST00000461017 INHBAP08476 426 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 ABHD2P08910 425 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 CD63P08962 238 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 SFTPCP11686 197 aa6.61□□□□□ -1.35
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RABGEF1-206ENST00000461017 GNAZP19086 355 aa6.61□□□□□ -1.35
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RABGEF1-206ENST00000461017 CHIT1Q13231 466 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 PWP1Q13610 501 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 SETDB1Q15047 1291 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 ACAP2Q15057 778 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 RBBP7Q16576 425 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 NDUFA9Q16795 377 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 PFKFB4Q16877 469 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 DEFB134Q4QY38 66 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF793Q6ZN11 406 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 SH2D5Q6ZV89 423 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKRD37Q7Z713 158 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 TCAIMQ8N3R3 496 aa6.61□□□□□ -1.35
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