RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM110Q86TL2 294 aa3.8□□□□□ -1.8
ECHDC1-211ENST00000460558 OOSP2Q86WS3 158 aa3.8□□□□□ -1.8
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ECHDC1-211ENST00000460558 SIAH3Q8IW03 269 aa3.8□□□□□ -1.8
ECHDC1-211ENST00000460558 CCDC28AQ8IWP9 274 aa3.8□□□□□ -1.8
ECHDC1-211ENST00000460558 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM178AQ8NBL3 297 aa3.8□□□□□ -1.8
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ECHDC1-211ENST00000460558 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
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ECHDC1-211ENST00000460558 TMTC1Q8IUR5 882 aa3.79□□□□□ -1.8
ECHDC1-211ENST00000460558 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa3.79□□□□□ -1.8
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ECHDC1-211ENST00000460558 CD84Q9UIB8 345 aa3.79□□□□□ -1.8
ECHDC1-211ENST00000460558 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
ECHDC1-211ENST00000460558 SHOC2Q9UQ13 582 aa3.79□□□□□ -1.8
ECHDC1-211ENST00000460558 CHST2Q9Y4C5 530 aa3.79□□□□□ -1.8
ECHDC1-211ENST00000460558 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa3.78□□□□□ -1.8
ECHDC1-211ENST00000460558 A0A1B0GTH9 108 aa3.78□□□□□ -1.8
ECHDC1-211ENST00000460558 OR6C74A6NCV1 312 aa3.78□□□□□ -1.8
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