RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455609.1

C9orf41-AS1-201, C9orf41 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf41-AS1, Length 719 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CREB3L4Q8TEY5 395 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PPP4R1Q8TF05 950 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OR1F2PQ96R84 312 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KLHL31Q9H511 634 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EPS8L2Q9H6S3 715 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LANCL2Q9NS86 450 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DNAJC11Q9NVH1 559 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GPRC5BQ9NZH0 403 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PTGFRNQ9P2B2 879 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MAP10Q9P2G4 905 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 VPS4AQ9UN37 437 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HMX2A2RU54 273 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 URADA6NGE7 173 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C4orf51C9J302 202 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CHST10O43529 356 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 STK16O75716 305 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 S100BP04271 92 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TUBB4AP04350 444 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SERPINA6P08185 405 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TFEBP19484 476 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IL10P22301 178 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PHBP35232 272 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SOX11P35716 441 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SKP1P63208 163 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MFAP5Q13361 173 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CRB2Q5IJ48 1285 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MROH9Q5TGP6 573 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NIPAL1Q6NVV3 410 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CEP128Q6ZU80 1094 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ANKRD37Q7Z713 158 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ISCA2Q86U28 154 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RELL1Q8IUW5 271 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SIRT6Q8N6T7 355 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SNX31Q8N9S9 440 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GALNT11Q8NCW6 608 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 STAG3L4Q8TBR4 150 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IFT81Q8WYA0 676 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PSMF1Q92530 271 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C19orf60Q96EN9 201 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IMMP1LQ96LU5 166 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FMO2Q99518 471 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TUBB6Q9BUF5 446 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CAPS2Q9BXY5 557 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AICDAQ9GZX7 198 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ACSS3Q9H6R3 686 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NMRAL1Q9HBL8 299 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NUDT4Q9NZJ9 180 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ASB1Q9Y576 335 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SHANK1Q9Y566 2161 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SUPT3HB4E1H0 165 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CLGNO14967 610 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PRAMEF4O60810 478 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KERAO60938 352 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SUPT3HO75486 399 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ACSL3O95573 720 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SMIM10L1P0DMW3 83 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ITGAMP11215 1152 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GNLYP22749 145 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ECHS1P30084 290 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IRF9Q00978 393 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RHAGQ02094 409 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PDK4Q16654 411 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LURAP1LQ8IV03 231 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KRT78Q8N1N4 520 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TTLQ8NG68 377 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DNAJB14Q8TBM8 379 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KCTD4Q8WVF5 259 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TBC1D20Q96BZ9 403 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NXNL1Q96CM4 212 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SMIM10Q96HG1 83 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CNDP1Q96KN2 507 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LMF1Q96S06 567 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ATOH8Q96SQ7 321 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EHD1Q9H4M9 534 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SNX15Q9NRS6 342 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 COPG2Q9UBF2 871 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ACOT9Q9Y305 439 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 A0A087X1B8 175 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 UBXN8O00124 270 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 WFS1O76024 890 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.1 ms