RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	PPT2	Q9UMR5	302 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	PLAA	Q9Y263	795 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	TLDC2	A0PJX2	215 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	CDC14C	A4D256	554 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	LRIT2	A6NDA9	550 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	SMIM23	A6NLE4	172 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	COPE	O14579	308 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	KLHL18	O94889	574 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	OTC	P00480	354 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	PRKAR1A	P10644	381 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	KRT4	P19013	534 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	MMP11	P24347	488 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	CCR10	P46092	362 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	PRKAA2	P54646	552 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	RRAD	P55042	308 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	TGM3	Q08188	693 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	HYAL2	Q12891	473 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	TBR1	Q16650	682 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	MED25	Q71SY5	747 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	SMIM10	Q96HG1	83 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	ACTR8	Q9H981	624 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	CTSF	Q9UBX1	484 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	MED13	Q9UHV7	2174 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1W2PQ72	361 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241		H3BQF6	201 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	CLDN9	O95484	217 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	MLYCD	O95822	493 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	SERPIND1	P05546	499 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	UMOD	P07911	640 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	IL1RN	P18510	177 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	IMPDH1	P20839	514 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	CCNG1	P51959	295 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	CYP4F2	P78329	520 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	ZYG11A	Q6WRX3	759 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	IQCK	Q8N0W5	287 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	OR2L5	Q8NG80	312 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	OR7G3	Q8NG95	312 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	MOCOS	Q96EN8	888 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	PEX12	O00623	359 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	DLX3	O60479	287 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	KLHL41	O60662	606 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	PLIN3	O60664	434 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	BMP10	O95393	424 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	PROC	P04070	461 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	FURIN	P09958	794 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	MYL2	P10916	166 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	DNAJB13	P59910	316 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	KLC1	Q07866	573 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF678	Q5SXM1	525 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	CHSY3	Q70JA7	882 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	PDSS2	Q86YH6	399 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	APOPT1	Q96IL0	206 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	FAR2	Q96K12	515 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		13.85	□□□□□ -0.19

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