RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439512.5

TOM1-207, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 3

Gene TOM1, Length 800 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-207ENST00000439512 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP15.62■□□□□ 0.094e-7■■■■■ 58.1
TOM1-207ENST00000439512 MTBPQ96DY7 904 aa15.62■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 VPS50Q96JG6 964 aa15.62■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 SLC6A16Q9GZN6 736 aa15.62■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 PRM3Q9NNZ6 103 aa15.62■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa15.62■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 C14orf105Q9NVL8 296 aa15.62■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 TBK1Q9UHD2 729 aa15.62■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 FBXL4Q9UKA2 621 aa15.62■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 MKL2Q9ULH7 1088 aa15.62■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 MED13Q9UHV7 2174 aa15.61■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 ALOX12BO75342 701 aa15.61■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 WFS1O76024 890 aa15.61■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 CD22P20273 847 aa15.61■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 CASP2P42575 452 aa15.61■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 XCR1P46094 333 aa15.61■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 LAPTM5Q13571 262 aa15.61■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 RAPSNQ13702 412 aa15.61■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 TBCCQ15814 346 aa15.61■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 PAGE2BQ5JRK9 111 aa15.61■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 MFSD4BQ5TF39 518 aa15.61■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 ASB18Q6ZVZ8 466 aa15.61■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 ZNF605Q86T29 641 aa15.61■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 OR11G2Q8NGC1 345 aa15.61■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 OR5T3Q8NGG3 340 aa15.61■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 C8orf44Q96CB5 159 aa15.61■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 PHF21BQ96EK2 531 aa15.61■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 WDR34Q96EX3 536 aa15.61■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 EFCAB11Q9BUY7 163 aa15.61■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 FETUBQ9UGM5 382 aa15.61■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 ZNF462Q96JM2 2506 aa15.61■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 OR2W5A6NFC9 320 aa15.6■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 CHST10O43529 356 aa15.6■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 CLEC3AO75596 197 aa15.6■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 CEACAM4O75871 244 aa15.6■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 PDGFAP04085 211 aa15.6■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 SHBGP04278 402 aa15.6■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 SMIM10L1P0DMW3 83 aa15.6■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 ACPPP15309 386 aa15.6■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 PGDP52209 483 aa15.6■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 VSNL1P62760 191 aa15.6■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 SKP1P63208 163 aa15.6■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 OLR1P78380 273 aa15.6■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP15.6■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 MINDY4Q4G0A6 757 aa15.6■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 ADNP2Q6IQ32 1131 aa15.6■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 PARP9Q8IXQ6 854 aa15.6■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 GALNT16Q8N428 558 aa15.6■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 PEX11GQ96HA9 241 aa15.6■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 SMIM10Q96HG1 83 aa15.6■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 AICDAQ9GZX7 198 aa15.6■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 MLXIPLQ9NP71 852 aa15.6■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 COPG2Q9UBF2 871 aa15.6■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 XPR1Q9UBH6 696 aa15.6■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP15.6■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 V9GYY5 206 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 SCN3AQ9NY46 2000 aa15.6■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 A0A0G2JN53 185 aa15.59■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 LRIT2A6NDA9 550 aa15.59■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 GOLGA8RI6L899 631 aa15.59■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 SMIM24O75264 130 aa15.59■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 GSTM2P28161 218 aa15.59■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 SLCO1A2P46721 670 aa15.59■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 BTN3A2P78410 334 aa15.59■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 TUBB8Q3ZCM7 444 aa15.59■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 NIPAL1Q6NVV3 410 aa15.59■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 VN1R5Q7Z5H4 357 aa15.59■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 METTL21AQ8WXB1 218 aa15.59■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 UBE2E3Q969T4 207 aa15.59■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 SEC16BQ96JE7 1060 aa15.59■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 FAR2Q96K12 515 aa15.59■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 NUDT9Q9BW91 350 aa15.59■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 VN1R1Q9GZP7 353 aa15.59■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 RHBGQ9H310 441 aa15.59■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 IPPKQ9H8X2 491 aa15.59■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 GPR83Q9NYM4 423 aa15.59■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 TMCO1Q9UM00 188 aa15.59■□□□□ 0.09
TOM1-207ENST00000439512 SMIM23A6NLE4 172 aa15.58■□□□□ 0.08
TOM1-207ENST00000439512 FOXO6A8MYZ6 492 aa15.58■□□□□ 0.08
TOM1-207ENST00000439512 ERI3O43414 337 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
TOM1-207ENST00000439512 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
TOM1-207ENST00000439512 PYGBP11216 843 aa15.58■□□□□ 0.08
TOM1-207ENST00000439512 PCNAP12004 261 aa15.58■□□□□ 0.08
TOM1-207ENST00000439512 IL10P22301 178 aa15.58■□□□□ 0.08
TOM1-207ENST00000439512 ITGA3P26006 1051 aa15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms