RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414620.1

ACTB-202, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-202ENST00000414620 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 EXT1Q16394 746 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 ZNF766Q5HY98 468 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 ACER2Q5QJU3 275 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 FRA10AC1Q70Z53 315 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 ABHD13Q7L211 337 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 ANKRD53Q8N9V6 530 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 PLPP5Q8NEB5 264 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 NT5CQ8TCD5 201 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 ANKRD49Q8WVL7 239 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 TBC1D20Q96BZ9 403 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 ZNF354BQ96LW1 612 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 OR1F2PQ96R84 312 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 LPAR4Q99677 370 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 DPH5Q9H2P9 285 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 RHBGQ9H310 441 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 KLHL31Q9H511 634 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 PELI2Q9HAT8 420 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 KLHL1Q9NR64 748 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 SMYD2Q9NRG4 433 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 MAGEB17A8MXT2 336 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 C4orf51C9J302 202 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 E7ESA3 106 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 FANCGO15287 622 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 WDR47O94967 919 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 UNC5CO95185 931 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 STSP08842 583 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 SLC26A5P58743 744 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 BTG2P78543 158 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 TUBA3CQ13748 450 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 TSNQ15631 228 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 MEP1AQ16819 746 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 TUBA3EQ6PEY2 450 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 NXPE4Q6UWF7 544 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 CEP97Q8IW35 865 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 CYP4X1Q8N118 509 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 KIF2BQ8N4N8 673 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 M1APQ8TC57 530 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 VPS39Q96JC1 886 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 AIF1LQ9BQI0 150 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 MMP25Q9NPA2 562 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 MOCS1Q9NZB8 636 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 ABI3Q9P2A4 366 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 SEC14L3Q9UDX4 400 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 OARD1Q9Y530 152 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 A0A0G2JN53 185 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 A0A1B0GUH1 482 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 GABRR3A8MPY1 467 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 WISP2O76076 250 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 CRYABP02511 175 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 IL10P22301 178 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 JAK1P23458 1154 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 SSTR1P30872 391 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 AHRP35869 848 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 GDF5P43026 501 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 SKP1P63208 163 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 HYAL2Q12891 473 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 H3F3CQ6NXT2 135 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 LURAP1LQ8IV03 231 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.072e-7■■□□□ 14.5
ACTB-202ENST00000414620 SPATA6LQ8N4H0 392 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 CCT6BQ92526 530 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 PTCHD1Q96NR3 888 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 SLC6A16Q9GZN6 736 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 AICDAQ9GZX7 198 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 RHOJQ9H4E5 214 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 CAB39LQ9H9S4 337 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 GPAMQ9HCL2 828 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 SAYSD1Q9NPB0 183 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 KCNE2Q9Y6J6 123 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 A8MUA0 341 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 FAM227AF5H4B4 570 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 MYBL2P10244 700 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 MAOAP21397 527 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 CD96P40200 585 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 SLC12A2P55011 1212 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 TAS2R50P59544 299 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 CDKL1Q00532 357 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 C2orf54Q08AI8 447 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 OR1C1Q15619 314 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 FBXO48Q5FWF7 155 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 SPINK14Q6IE38 97 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa14.59□□□□□ -0.07
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