RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410277.1

RNA5SP56-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 56, humanhuman

BASIC

Gene RNA5SP56, Length 118 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNA5SP56-201ENST00000410277 MLLT10P55197 1068 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 ZXDBP98169 803 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 TNFRSF17Q02223 184 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 COX10Q12887 443 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 TAF10Q12962 218 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 KEAP1Q14145 624 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 DUOXA1Q1HG43 343 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 CCDC57Q2TAC2 916 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 ADPRMQ3LIE5 342 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 GPAT3Q53EU6 434 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 AGKQ53H12 422 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 ASPRV1Q53RT3 343 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 C20orf194Q5TEA3 1177 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 IGFL4Q6B9Z1 124 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 OLFML1Q6UWY5 402 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 PACS1Q6VY07 963 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 PRUNE1Q86TP1 453 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 ODF3L1Q8IXM7 274 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 EID3Q8N140 333 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 PRSS35Q8N3Z0 413 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 TRIM58Q8NG06 486 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 OR2T3Q8NH03 318 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 METTL21AQ8WXB1 218 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 TANKQ92844 425 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 CASP10Q92851 521 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 GLYATL1Q969I3 302 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 FBXO32Q969P5 355 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 C4orf36Q96KX1 117 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 GPR137Q96N19 417 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 PSKH2Q96QS6 385 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 OR1F2PQ96R84 312 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 SLC25A33Q9BSK2 321 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 C5orf66Q9H5L9 145 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 PLAC1Q9HBJ0 212 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 HPS4Q9NQG7 708 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 RDH8Q9NYR8 311 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 TEKT2Q9UIF3 430 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 KCNS2Q9ULS6 477 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 FZD10Q9ULW2 581 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 CLEC4AQ9UMR7 237 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 ERVK-19Q9WJR5 959 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 C2CD2Q9Y426 696 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa3.54□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 NSD2O96028 1365 aa3.53□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 A0A0G2JNG1 304 aa3.53□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 LINC01553A4QN01 128 aa3.53□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 LILRA5A6NI73 299 aa3.53□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 NPIPB8E9PQR5 432 aa3.53□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 MID1O15344 667 aa3.53□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 CLN5O75503 358 aa3.53□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 C1QL1O75973 258 aa3.53□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 GAGE7O76087 117 aa3.53□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 KDM4BO94953 1096 aa3.53□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 CLDN14O95500 239 aa3.53□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 CPNE6O95741 557 aa3.53□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 SYF2O95926 243 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 MBD3O95983 291 aa3.53□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 EPOP01588 193 aa3.53□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 PRKCGP05129 697 aa3.53□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 IQCF3P0C7M6 154 aa3.53□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 GAGE12FP0CL80 117 aa3.53□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 GAGE12GP0CL81 117 aa3.53□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 GAGE12IP0CL82 117 aa3.53□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 ODC1P11926 461 aa3.53□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 CEACAM1P13688 526 aa3.53□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 PAX7P23759 505 aa3.53□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 PTPN6P29350 595 aa3.53□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP3.53□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 OR3A3P47888 321 aa3.53□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 SLC1A6P48664 564 aa3.53□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 PEX5P50542 639 aa3.53□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 THOP1P52888 689 aa3.53□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 VCPP55072 806 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 FUT7Q11130 342 aa3.53□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 GAGE1Q13065 139 aa3.53□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 GAGE4Q13068 117 aa3.53□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 GPS2Q13227 327 aa3.53□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 NME3Q13232 169 aa3.53□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 MFAP5Q13361 173 aa3.53□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 GTF2H2Q13888 395 aa3.53□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 KIR2DS5Q14953 304 aa3.53□□□□□ -1.84
RNA5SP56-201ENST00000410277 OPCMLQ14982 345 aa3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms