RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405546.7

ATG4B-206, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 3,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-206ENST00000405546 GPR83Q9NYM4 423 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 USP34Q70CQ2 3546 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 STSP08842 583 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 POU2F1P14859 743 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 DDX5P17844 614 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 MAPK1P28482 360 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 CLDN8P56748 225 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 DEFA1P59665 94 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 DEFA3P59666 94 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 CDC20Q12834 499 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 CYP27C1Q4G0S4 372 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 GLCCI1Q86VQ1 547 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 SLC43A3Q8NBI5 491 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 MAL2Q969L2 176 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 SPASTQ9UBP0 616 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 TEKT2Q9UIF3 430 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 PPT2Q9UMR5 302 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 SPEF1Q9Y4P9 236 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 A0A1W2PQ72 361 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 PITPNM1O00562 1244 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 HAT1O14929 419 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 AKR7A2O43488 359 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 TGM5O43548 720 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 SOCS5O75159 536 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 POP4O95707 220 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 CXCL14O95715 111 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 OPN1SWP03999 348 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 NNMTP40261 264 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 SLC15A1P46059 708 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 P2RX3P56373 397 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 RAB33AQ14088 237 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 KIAA0040Q15053 153 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 CDK10Q15131 360 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 HKDC1Q2TB90 917 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 ARSIQ5FYB1 569 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 ADNP2Q6IQ32 1131 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 CCDC120Q96HB5 630 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 SLC46A2Q9BY10 475 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 SGK2Q9HBY8 427 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 C5orf42Q9H799 3197 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 TMEM202A6NGA9 273 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 M0R082 166 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 CTSKP43235 329 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 RAB25P57735 213 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 ACOX1Q15067 660 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 MED22Q15528 200 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 ZNF181Q2M3W8 571 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 FAM180BQ6P0A1 224 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 TRIM46Q7Z4K8 759 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 C11orf74Q86VG3 221 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 AMER2Q8N7J2 671 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 KCNH6Q9H252 994 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 A0A0X1KG70 313 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 OR6C70A6NIJ9 312 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 RGS13O14921 159 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 ALX3O95076 343 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 PRPS2P11908 318 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 TNFRSF1BP20333 461 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 CRATP43155 626 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 DMC1Q14565 340 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 TTC23LQ6PF05 361 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 CACUL1Q86Y37 369 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 PEX5LQ8IYB4 626 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 C7orf57Q8NEG2 295 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 ASZ1Q8WWH4 475 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 NELL1Q92832 810 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 SNAPC3Q92966 411 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 ST6GAL2Q96JF0 529 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 IL21Q9HBE4 155 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 KRT84Q9NSB2 600 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 MUTYHQ9UIF7 546 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 MAGEB17A8MXT2 336 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 SEMA3DO95025 777 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 GRK3P35626 688 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 BDKRB1P46663 353 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 SPINT3P49223 89 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 CCSMST1Q4G0I0 132 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 ZNF544Q6NX49 715 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 FIBINQ8TAL6 211 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 ACAT2Q9BWD1 397 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 ITPAQ9BY32 194 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 ASAH2Q9NR71 780 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 RAD18Q9NS91 495 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 SIRT5Q9NXA8 310 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 ITM2BQ9Y287 266 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms