RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 FLRT1Q9NZU1 646 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 FBXW2Q9UKT8 454 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 KCTD3Q9Y597 815 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 A0A0G2JMP0 313 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1W2PRB8 838 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 OR1F1O43749 312 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 SLITRK5O94991 958 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 T-ENOLP0DO92 83 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 AHCYP23526 432 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 UGT2B10P36537 528 aa8.6□□□□□ -1.03
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PTPRM-202ENST00000400053 ST3GAL4Q11206 333 aa8.6□□□□□ -1.03
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PTPRM-202ENST00000400053 SNX29P2Q8IUI4 249 aa8.6□□□□□ -1.03
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PTPRM-202ENST00000400053 FBXO22Q8NEZ5 403 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 OR4M2Q8NGB6 313 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa8.6□□□□□ -1.03
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PTPRM-202ENST00000400053 EFCAB11Q9BUY7 163 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 OR10A4Q9H209 315 aa8.6□□□□□ -1.03
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PTPRM-202ENST00000400053 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 ERVK-18Q9QC07 812 aa8.6□□□□□ -1.03
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PTPRM-202ENST00000400053 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 M0R036 132 aa8.6□□□□□ -1.03
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PTPRM-202ENST00000400053 CH25HO95992 272 aa8.6□□□□□ -1.03
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PTPRM-202ENST00000400053 SPATA31D3P0C874 917 aa8.6□□□□□ -1.03
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PTPRM-202ENST00000400053 AGXTP21549 392 aa8.6□□□□□ -1.03
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PTPRM-202ENST00000400053 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 PM20D2Q8IYS1 436 aa8.6□□□□□ -1.03
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PTPRM-202ENST00000400053 TLL1O43897 1013 aa8.59□□□□□ -1.03
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PTPRM-202ENST00000400053 CXCR1P25024 350 aa8.59□□□□□ -1.03
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PTPRM-202ENST00000400053 HERV-K104P61576 105 aa8.59□□□□□ -1.03
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PTPRM-202ENST00000400053 HMBOX1Q6NT76 420 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 HFE2Q6ZVN8 426 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 P4HA3Q7Z4N8 544 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 OXR1Q8N573 874 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 OR4F6Q8NGB9 312 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 OR6K6Q8NGW6 343 aa8.59□□□□□ -1.03
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PTPRM-202ENST00000400053 HEPHQ9BQS7 1158 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 ANKRD12Q6UB98 2062 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 TRBC2A0A5B9 178 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 FUOMA2VDF0 154 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 DENRO43583 198 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 TAS2R43P59537 309 aa8.59□□□□□ -1.03
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