RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 TSSK3Q96PN8 268 aa22.19■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 NCDNQ9UBB6 729 aa22.19■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 TMED5Q9Y3A6 229 aa22.19■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 EEDO75530 441 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 KLK1P06870 262 aa22.19■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 CPA2P48052 419 aa22.19■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 KCNAB1Q14722 419 aa22.19■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 DNAJC22Q8N4W6 341 aa22.19■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 CD180Q99467 661 aa22.19■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 SLC6A16Q9GZN6 736 aa22.19■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 STARD5Q9NSY2 213 aa22.19■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 FLRT2O43155 660 aa22.18■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 GDF9O60383 454 aa22.18■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 GSTM2P28161 218 aa22.18■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 BSGP35613 385 aa22.18■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 CSRP2Q16527 193 aa22.18■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa22.18■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 GALNT18Q6P9A2 607 aa22.18■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 TCTN2Q96GX1 697 aa22.18■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 C17orf62Q9BQA9 187 aa22.18■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 LRRN3Q9H3W5 708 aa22.18■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 TMEM9BQ9NQ34 198 aa22.18■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 GABRA4P48169 554 aa22.18■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 SQSTM1Q13501 440 aa22.18■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 SNX32Q86XE0 403 aa22.18■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 NSL1Q96IY1 281 aa22.18■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 SOHLH2Q9NX45 425 aa22.18■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 SPTBP11277 2137 aa22.17■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 C4orf47A7E2U8 309 aa22.17■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 ERI3O43414 337 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 PCDH7O60245 1069 aa22.17■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 SLC22A3O75751 556 aa22.17■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 SEMA3DO95025 777 aa22.17■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 COX4I1P13073 169 aa22.17■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 CKMT2P17540 419 aa22.17■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.143e-7■■■■■ 34.5
CNN3-202ENST00000394202 RAB8AP61006 207 aa22.17■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 PWP1Q13610 501 aa22.17■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 FBXO27Q8NI29 283 aa22.17■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 NT5CQ8TCD5 201 aa22.17■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 RGMAQ96B86 450 aa22.17■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa22.17■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 SIRT5Q9NXA8 310 aa22.17■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 SEMA5BQ9P283 1151 aa22.17■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 ZNF292O60281 2723 aa22.16■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 SLC22A2O15244 555 aa22.16■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 LRATO95237 230 aa22.16■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 CPNE6O95741 557 aa22.16■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 RAP1GDS1P52306 607 aa22.16■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 SLC14A1Q13336 389 aa22.16■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 TMEM71Q6P5X7 295 aa22.16■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 ABHD17CQ6PCB6 329 aa22.16■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 ZNF793Q6ZN11 406 aa22.16■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 THAP11Q96EK4 314 aa22.16■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 TMEM74Q96NL1 305 aa22.16■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 TAGLN3Q9UI15 199 aa22.16■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa22.16■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 SLC35G6P0C7Q6 338 aa22.16■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 ACPPP15309 386 aa22.16■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 ACADVLP49748 655 aa22.16■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 TMEM35AQ53FP2 167 aa22.16■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 OR2L5Q8NG80 312 aa22.16■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 SLC52A3Q9NQ40 469 aa22.16■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 PRDM7Q9NQW5 492 aa22.16■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 ZIM2Q9NZV7 527 aa22.16■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 AGRPO00253 132 aa22.15■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 PRPS2P11908 318 aa22.15■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 OR4C11Q6IEV9 310 aa22.15■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 NAXDQ8IW45 347 aa22.15■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 CSNK1A1LQ8N752 337 aa22.15■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 CDC26Q8NHZ8 85 aa22.15■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 PDE7BQ9NP56 450 aa22.15■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 FTSJ1Q9UET6 329 aa22.15■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 CBFA2T3O75081 653 aa22.14■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 MYO1DO94832 1006 aa22.14■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 UNC5CO95185 931 aa22.14■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
CNN3-202ENST00000394202 MAPK1P28482 360 aa22.14■■□□□ 1.14
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