RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389413.7

PTPRN2-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN2, Length 4,723 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-201ENST00000389413 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 FAM129BQ96TA1 746 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 RACGAP1Q9H0H5 632 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 MED28Q9H204 178 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 WDR26Q9H7D7 661 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 TMEM138Q9NPI0 162 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 ERI3O43414 337 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 DCTP40126 519 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 GTDC1Q4AE62 458 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 CADM2Q8N3J6 435 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 KLHL36Q8N4N3 616 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 ANKLE1Q8NAG6 615 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 RHBDF1Q96CC6 855 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 TMEM80Q96HE8 168 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 OR51V1Q9H2C8 321 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 VAPAQ9P0L0 249 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 UTS2RQ9UKP6 389 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 MMP20O60882 483 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 CYBAP13498 195 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC36A3Q495N2 470 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 APCDD1Q8J025 514 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 WDR48Q8TAF3 677 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 GLYATL1Q969I3 302 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 C7orf72A4D263 438 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 LEFTY1O75610 366 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC25A12O75746 678 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 ACRP10323 421 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 LRRC32Q14392 662 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 TRAM1L1Q8N609 369 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 NETO1Q8TDF5 533 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 OMPP47874 163 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 SH2D5Q6ZV89 423 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 FLCNQ8NFG4 579 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 FRS2Q8WU20 508 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 IRF7Q92985 503 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 IL26Q9NPH9 171 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 PHF11Q9UIL8 331 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 IRAK3Q9Y616 596 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 DAPL1A0PJW8 107 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 MROH6A6NGR9 719 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 CCRL2O00421 344 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 UQCRC2P22695 453 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 RETREG3Q86VR2 466 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 TMC8Q8IU68 726 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 COX18Q8N8Q8 333 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 MS4A4AQ96JQ5 239 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 IFT27Q9BW83 186 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 HEBP1Q9NRV9 189 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC31A1O15431 190 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 CDK4P11802 303 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 XKR4Q5GH76 650 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 C17orf99Q6UX52 265 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 ZSWIM9Q86XI8 627 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 TCEANCQ8N8B7 351 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 MOSPD2Q8NHP6 518 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 VMP1Q96GC9 406 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 LMLNQ96KR4 655 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC12A9Q9BXP2 914 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 SRMSQ9H3Y6 488 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 TUBB3Q13509 450 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 VTCN1Q7Z7D3 282 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC39A13Q96H72 371 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 PIP5K1AQ99755 562 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 RWDD3Q9Y3V2 267 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 H7C0S8 307 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 ACOT8O14734 319 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 CDRT1O95170 752 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 RYKP34925 604 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP15.55■□□□□ 0.088e-7■■□□□ 12.1
PTPRN2-201ENST00000389413 TEAD2Q15562 447 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 CYP27C1Q4G0S4 372 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 IDNKQ5T6J7 187 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 NHSQ6T4R5 1651 aa15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms