RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366955.7

CENPF-201, Transcript of centromere protein F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CENPF, Length 10,307 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPF-201ENST00000366955 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 MANBAO00462 879 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 TGFB1P01137 390 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 GYS2P54840 703 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 WNT3AP56704 352 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 PSME3P61289 254 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 CCZ1BP86790 482 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 WASHC2DQ5SRD0 308 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 ZNF550Q7Z398 422 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 ZNF615Q8N8J6 731 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 C12orf29Q8N999 325 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 CMTM3Q96MX0 182 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 A0A0A0MRY4 1105 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 A0A1B0GVC2 190 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 OAZ2O95190 189 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 CBLP22681 906 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 PTP4A2Q12974 167 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 MYLK3Q32MK0 819 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 UTS2BQ765I0 119 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 OR52E4Q8NGH9 312 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 SCGB1C1Q8TD33 95 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 GRHL3Q8TE85 626 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 SPATA13Q96N96 652 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 AP1S3Q96PC3 154 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 GAL3ST1Q99999 423 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 ETNK2Q9NVF9 386 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 ABCC6O95255 1503 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 FUOMA2VDF0 154 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 SIGLEC6O43699 453 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 GZMAP12544 262 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 MAOBP27338 520 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 VASPP50552 380 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 CDONQ4KMG0 1287 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 PYDC2Q56P42 97 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 SPATA19Q7Z5L4 167 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 DHFR2Q86XF0 187 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 SLC30A8Q8IWU4 369 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 OR1N1Q8NGS0 311 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 GPT2Q8TD30 523 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 CREB3L4Q8TEY5 395 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 LRRC1Q9BTT6 524 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 DOHHQ9BU89 302 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 EGLN1Q9GZT9 426 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 RIOX1Q9H6W3 641 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 POT1Q9NUX5 634 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 FKBPLQ9UIM3 349 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 RAB21Q9UL25 225 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 A0A1W2PQ09 198 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 MRASO14807 208 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 MYF5P13349 255 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 MAN2A2P49641 1150 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 SIGLEC14Q08ET2 396 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 CHIT1Q13231 466 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 CASP8Q14790 479 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 UNC5AQ6ZN44 842 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 CAMKMTQ7Z624 323 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 SLC13A3Q8WWT9 602 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 OMA1Q96E52 524 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 PCED1BQ96HM7 432 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 PWWP2AQ96N64 755 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 IFT27Q9BW83 186 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 RBCK1Q9BYM8 510 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 C14orf105Q9NVL8 296 aa3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 TMEM150BA6NC51 233 aa3.98□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 LGALS8O00214 317 aa3.98□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 HAT1O14929 419 aa3.98□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 RETP07949 1114 aa3.98□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 CD3GP09693 182 aa3.98□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 H2BFMP0C1H6 154 aa3.98□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 PCSK2P16519 638 aa3.98□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 PGCP20142 388 aa3.98□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 SLC19A1P41440 591 aa3.98□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 TSFMP43897 325 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 ARSKQ6UWY0 536 aa3.98□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 UNC5DQ6UXZ4 953 aa3.98□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 MAP4K3Q8IVH8 894 aa3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms