RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 TPSB2P20231 275 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PSMB5P28074 263 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ECHS1P30084 290 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TRPC1P48995 793 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ACADVLP49748 655 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TAS2R38P59533 333 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ERVPABLB-1P60509 514 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 HSPB3Q12988 150 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF460Q14592 562 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CLCA4Q14CN2 919 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TPSAB1Q15661 275 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CATSPEREQ5SY80 951 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 C3P1Q6ZMU1 363 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 POMGNT2Q8NAT1 580 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ASB12Q8WXK4 309 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 THAP4Q8WY91 577 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 HIST1H2ACQ93077 130 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 YIPF4Q9BSR8 244 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TAPBPLQ9BX59 468 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 RNF32Q9H0A6 362 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ALG2Q9H553 416 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM184CQ9NVA4 438 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 A0A0C4DFX4 3053 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 A0A087X1B8 175 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 A0A0G2JND7 137 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 AGPSO00116 658 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PEX11AO75192 247 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ALOX12BO75342 701 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 C2P06681 752 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 GP1BAP07359 652 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PYGBP11216 843 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 COX6B1P14854 86 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SERPINB3P29508 390 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 RFC3P40938 356 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 EPHA4P54764 986 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TBPL1P62380 186 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 KCNJ11Q14654 390 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 WLSQ5T9L3 541 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ISLR2Q6UXK2 745 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PACS2Q86VP3 889 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PIANPQ8IYJ0 282 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 COX18Q8N8Q8 333 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 OR8K5Q8NH50 307 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ZUFSPQ96AP4 578 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TBC1D20Q96BZ9 403 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 RTP4Q96DX8 246 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CMTM7Q96FZ5 175 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 DPH1Q9BZG8 443 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CDCP1Q9H5V8 836 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 VIPAS39Q9H9C1 493 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CD248Q9HCU0 757 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SERINC1Q9NRX5 453 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SPHK1Q9NYA1 384 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 EHD3Q9NZN3 535 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 XPR1Q9UBH6 696 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SLC23A2Q9UGH3 650 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP4.25□□□□□ -1.731e-11■■■■□ 24.8
PTPRC-201ENST00000348564 RTCAO00442 366 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 GNB5O14775 395 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 NQO1P15559 274 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 S100A3P33764 101 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CD68P34810 354 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 MTTPP55157 894 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PLCXD2Q0VAA5 305 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 C1DQ13901 141 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 STK11Q15831 433 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SFT2D3Q587I9 215 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 OPN5Q6U736 354 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 RNF44Q7L0R7 432 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 KIRREL3Q8IZU9 778 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PGBD5Q8N414 524 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 OR51Q1Q8NH59 317 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CLHC1Q8NHS4 586 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CT55Q8WUE5 264 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM237Q96Q45 408 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SERPINI1Q99574 410 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 MED4Q9NPJ6 270 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SEMA3GQ9NS98 782 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 EXD2Q9NVH0 621 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SPATA7Q9P0W8 599 aa4.25□□□□□ -1.73
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