RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 HYKKA2RU49 373 aa26.44■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 SH3BGRLO75368 114 aa26.44■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 SEMA3DO95025 777 aa26.44■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP26.44■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 MAPK10P53779 464 aa26.44■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 ARSFP54793 590 aa26.44■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 MUM1Q2TAK8 710 aa26.44■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 XKR7Q5GH72 579 aa26.44■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 DCAF12Q5T6F0 453 aa26.44■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 TRIM40Q6P9F5 258 aa26.44■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 FOXR1Q6PIV2 292 aa26.44■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM126BQ8IUX1 230 aa26.44■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 OR2L5Q8NG80 312 aa26.44■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 MS4A6EQ96DS6 147 aa26.44■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 TAAR9Q96RI9 348 aa26.44■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 SIKE1Q9BRV8 207 aa26.44■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 ZPBPQ9BS86 351 aa26.44■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 NDC1Q9BTX1 674 aa26.44■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 TRIM55Q9BYV6 548 aa26.44■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 MEAF6Q9HAF1 191 aa26.44■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 SRPK3Q9UPE1 567 aa26.44■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 ETHE1O95571 254 aa26.43■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 JUNP05412 331 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 RAP1GDS1P52306 607 aa26.43■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 ARFIP1P53367 373 aa26.43■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 HMGCS1Q01581 520 aa26.43■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 CTRCQ99895 268 aa26.43■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa26.43■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa26.43■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 AHSPQ9NZD4 102 aa26.43■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 SLC22A7Q9Y694 548 aa26.43■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 GMNCA6NCL1 334 aa26.43■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF749O43361 778 aa26.43■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 ERI3O43414 337 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 HERC3Q15034 1050 aa26.43■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa26.43■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 RGMAQ96B86 450 aa26.43■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 DDA1Q9BW61 102 aa26.43■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 KLHL31Q9H511 634 aa26.43■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 CUTCQ9NTM9 273 aa26.43■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 CCL27Q9Y4X3 112 aa26.43■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa26.43■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa26.43■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 SCRG1O75711 98 aa26.42■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 HBQ1P09105 142 aa26.42■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 SPTBP11277 2137 aa26.42■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 ETV5P41161 510 aa26.42■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 ID4P47928 161 aa26.42■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 FAM53BQ14153 422 aa26.42■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 NR6A1Q15406 480 aa26.42■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 SPDYAQ5MJ70 313 aa26.42■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM164Q5U3C3 297 aa26.42■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa26.42■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 Q6ZSR9 355 aa26.42■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa26.42■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 PPP1R36Q96LQ0 422 aa26.42■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 KCNC2Q96PR1 638 aa26.42■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 AICDAQ9GZX7 198 aa26.42■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 NPHS2Q9NP85 383 aa26.42■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 A0A088AWK7 358 aa26.41■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 NPIPB8E9PQR5 432 aa26.41■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 VPS4BO75351 444 aa26.41■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 ALOX12P18054 663 aa26.41■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 PRPH2P23942 346 aa26.41■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 SEC24CP53992 1094 aa26.41■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 SKP1P63208 163 aa26.41■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 NIPAL1Q6NVV3 410 aa26.41■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa26.41■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 OR2T11Q8NH01 316 aa26.41■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 TUBGCP3Q96CW5 907 aa26.41■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 C10orf90Q96M02 699 aa26.41■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 C3orf30Q96M34 536 aa26.41■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 SAP18O00422 153 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF195O14628 629 aa26.41■■□□□ 1.82
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GIPC1-201ENST00000345425 GCGRP47871 477 aa26.41■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 PLA2G16P53816 162 aa26.41■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 SPIN4Q56A73 249 aa26.41■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 ABHD17CQ6PCB6 329 aa26.41■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 PPP3R2Q96LZ3 170 aa26.41■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 C17orf62Q9BQA9 187 aa26.41■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 TBCDQ9BTW9 1192 aa26.41■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 ROGDIQ9GZN7 287 aa26.41■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa26.41■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 ANKHQ9HCJ1 492 aa26.41■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 TXLNGQ9NUQ3 528 aa26.41■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa26.41■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa26.4■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 PLPP1O14494 284 aa26.4■■□□□ 1.82
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