RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344376.9

ATG4B-201, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 1,566 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-201ENST00000344376 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 Q0VFX4 171 aa15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 PDK4Q16654 411 aa15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 CRB2Q5IJ48 1285 aa15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 MROH9Q5TGP6 573 aa15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 CEP112Q8N8E3 955 aa15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 Q8NA96 180 aa15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 MYRIPQ8NFW9 859 aa15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 PPP4R1Q8TF05 950 aa15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 PEX11GQ96HA9 241 aa15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 SEC16BQ96JE7 1060 aa15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 SLC29A3Q9BZD2 475 aa15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 SLC6A16Q9GZN6 736 aa15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 EHD1Q9H4M9 534 aa15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 MYO18BQ8IUG5 2567 aa15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 CCDC189A1A4V9 331 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 SYCE1LA8MT33 242 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 SUPT3HB4E1H0 165 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 TAPBPO15533 448 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 KERAO60938 352 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 SUPT3HO75486 399 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 WFS1O76024 890 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 HNF4AP41235 474 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 SERPINB8P50452 374 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 MFAP5Q13361 173 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 BMPR2Q13873 1038 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 PCOLCEQ15113 449 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 FAM83EQ2M2I3 478 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 IGFL2Q6UWQ7 119 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 Q6ZS92 163 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 TAOK1Q7L7X3 1001 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP15.17■□□□□ 0.027e-6■■■□□ 16.3
ATG4B-201ENST00000344376 GALNT11Q8NCW6 608 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 OR5T3Q8NGG3 340 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 CCT6BQ92526 530 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 TBC1D20Q96BZ9 403 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 LMF1Q96S06 567 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 RBCK1Q9BYM8 510 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 NT5DC2Q9H857 520 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 IKBKGQ9Y6K9 419 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 A0A088AWK7 358 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 ACSL3O95573 720 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 FHP07954 510 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 INHBAP08476 426 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 RAB8AP61006 207 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 LAPTM5Q13571 262 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 FBXO48Q5FWF7 155 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 XKR6Q5GH73 641 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 PAGE2BQ5JRK9 111 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 KLC3Q6P597 504 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 LINC00696Q6ZRV3 163 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 ISCA2Q86U28 154 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 CREB3L4Q8TEY5 395 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 FAR2Q96K12 515 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 CNDP1Q96KN2 507 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 EFCAB11Q9BUY7 163 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 PRM3Q9NNZ6 103 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 SNX15Q9NRS6 342 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 IGSF5Q9NSI5 407 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 DYTNA2CJ06 578 aa15.15■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 ANKDD1BA6NHY2 528 aa15.15■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 CHST10O43529 356 aa15.15■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 TYK2P29597 1187 aa15.15■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 OLR1P78380 273 aa15.15■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 DLG1Q12959 904 aa15.15■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 ABRAXAS2Q15018 415 aa15.15■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 NSDHLQ15738 373 aa15.15■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa15.15■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 LANCL3Q6ZV70 420 aa15.15■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 ANKRD37Q7Z713 158 aa15.15■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 DNAJB14Q8TBM8 379 aa15.15■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 GAL3ST3Q96A11 431 aa15.15■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 ESAMQ96AP7 390 aa15.15■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 CD244Q9BZW8 370 aa15.15■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 PTGFRNQ9P2B2 879 aa15.15■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 COPG2Q9UBF2 871 aa15.15■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 TEKT2Q9UIF3 430 aa15.15■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 A0A096LPK6 155 aa15.15■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 MAGEB17A8MXT2 336 aa15.15■□□□□ 0.02
ATG4B-201ENST00000344376 CLEC3AO75596 197 aa15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms