RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343017.11

SNX18-202, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

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Gene SNX18, Length 3,140 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-202ENST00000343017 SLC39A13Q96H72 371 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 COPS8Q99627 209 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 PRSS21Q9Y6M0 314 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 EPN2O95208 641 aa14.67□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 GANABQ14697 944 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa14.67□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
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SNX18-202ENST00000343017 POLHQ9Y253 713 aa14.67□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 DOCK4Q8N1I0 1966 aa14.67□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 PRAMEF25A6NGN4 478 aa14.67□□□□□ -0.06
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SNX18-202ENST00000343017 HLA-EP13747 358 aa14.67□□□□□ -0.06
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SNX18-202ENST00000343017 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
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SNX18-202ENST00000343017 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
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SNX18-202ENST00000343017 C22orf42Q6IC83 251 aa14.66□□□□□ -0.06
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SNX18-202ENST00000343017 UAP1L1Q3KQV9 507 aa14.66□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 CST9Q5W186 159 aa14.66□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 FAM151BQ6UXP7 276 aa14.66□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 NAGSQ8N159 534 aa14.66□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 SYT14Q8NB59 555 aa14.66□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 EID2BQ96D98 161 aa14.66□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 GLTPQ9NZD2 209 aa14.66□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 CSO75390 466 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 CCNB2O95067 398 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 C1QBP02746 253 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 NUDT1P36639 197 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 WNT3P56703 355 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 UPP1Q16831 310 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 MPPE1Q53F39 396 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 OR8H3Q8N146 312 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 SLC43A3Q8NBI5 491 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 PKMYT1Q99640 499 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
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