RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334186.8

PPFIA3-201, Transcript of PTPRF interacting protein alpha 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPFIA3, Length 4,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3-201ENST00000334186 ZNF81P51508 661 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 PGGT1BP53609 377 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 SEC13P55735 322 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 CMTM7Q96FZ5 175 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 HSH2DQ96JZ2 352 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 DPEP2Q9H4A9 486 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 RETREG1Q9H6L5 497 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 GABRQQ9UN88 632 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 INSL6Q9Y581 213 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 OR1I1O60431 355 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 KLK1P06870 262 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 BDKRB1P46663 353 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 CAMK1GQ96NX5 476 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 GPR62Q9BZJ7 368 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 GON4LQ3T8J9 2241 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 GCAP28676 217 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 CD40LGP29965 261 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 GJA5P36382 358 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 PITPNAQ00169 270 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 SP140Q13342 867 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 ADAM15Q13444 863 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 NFATC2Q13469 925 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 UNC50Q53HI1 259 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 CRB2Q5IJ48 1285 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 GARNL3Q5VVW2 1013 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 UBE2UQ5VVX9 321 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 RGMAQ96B86 450 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 SEC14L4Q9UDX3 406 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 RIMS3Q9UJD0 308 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 HCN1O60741 890 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 TYRP14679 529 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 CDK6Q00534 326 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 LRRC32Q14392 662 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 SNAP47Q5SQN1 464 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 LRRTM4Q86VH4 590 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 MND1Q9BWT6 205 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 ERVK13-1Q9NX77 482 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 WNT6Q9Y6F9 365 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa15.94■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 SMIM30A4D0T7 59 aa15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 VILLO15195 856 aa15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 ERP29P30040 261 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 MPIP34949 423 aa15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 SLC25A24Q6NUK1 477 aa15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 ZNF783Q6ZMS7 281 aa15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 COX18Q8N8Q8 333 aa15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 SNX33Q8WV41 574 aa15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 SMPDL3AQ92484 453 aa15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 IGSF21Q96ID5 467 aa15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 DHRS4Q9BTZ2 278 aa15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 SLC6A15Q9H2J7 730 aa15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 HCN2Q9UL51 889 aa15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 NME4O00746 187 aa15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 NUAK1O60285 661 aa15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 DGKEP52429 567 aa15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 OR4D2P58180 307 aa15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 JAZF1Q86VZ6 243 aa15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 ADAP2Q9NPF8 381 aa15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 MAB21L2Q9Y586 359 aa15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 DUXAA6NLW8 204 aa15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 MEIS3P2A8K0S8 358 aa15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 L7N2F9 121 aa15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 MATN4O95460 622 aa15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 ALPPP05187 535 aa15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 GKP32189 559 aa15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 RPA4Q13156 261 aa15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 SWI5Q1ZZU3 235 aa15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 B3GALT2O43825 422 aa15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 ACTR1BP42025 376 aa15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 CLCNKAP51800 687 aa15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 ACTR1AP61163 376 aa15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 CD47Q08722 323 aa15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 Q6ZVL8 140 aa15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 LINGO2Q7L985 606 aa15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 OR10H4Q8NGA5 316 aa15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 PCDH10Q9P2E7 1040 aa15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 P2RX2Q9UBL9 471 aa15.93■□□□□ 0.14
PPFIA3-201ENST00000334186 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.1 ms