RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 NANOGP8Q6NSW7 305 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC2A7Q6PXP3 512 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 DHDDSQ86SQ9 333 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 GKN2Q86XP6 184 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 RIMKLAQ8IXN7 391 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF148Q8N7C7 305 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR156Q8NFN8 814 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 OR2L3Q8NG85 312 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 GTF2H4Q92759 462 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 RGMAQ96B86 450 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 LRGUKQ96M69 825 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 HSPA12BQ96MM6 686 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM74Q96NL1 305 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 GBP5Q96PP8 586 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 CGREF1Q99674 301 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 ECSITQ9BQ95 431 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 DPH7Q9BTV6 452 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNH6Q9H252 994 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 NANOGQ9H9S0 305 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 ATAD3AQ9NVI7 634 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 ABCD2Q9UBJ2 740 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 SPASTQ9UBP0 616 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 MUTYHQ9UIF7 546 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 MCM8Q9UJA3 840 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 DOLKQ9UPQ8 538 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 C5orf42Q9H799 3197 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 BPTFQ12830 3046 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1W2PR77 199 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 FEZF1A0PJY2 475 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 H0Y3Z8 333 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 AKAP10O43572 662 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 PCDH7O60245 1069 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 GMNNO75496 209 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 LRATO95237 230 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 ANP32DO95626 131 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 KLK1P06870 262 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 HSD17B1P14061 328 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 NME1P15531 152 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 MAOBP27338 520 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 AHRP35869 848 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 HPCAL1P37235 193 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 DPP6P42658 865 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 GSTM5P46439 218 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 C21orf59P57076 290 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 MS4A2Q01362 244 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 TNP2Q05952 138 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC34A1Q06495 639 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF763Q0D2J5 394 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 MAP7Q14244 749 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 RCN1Q15293 331 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 ZFP1Q6P2D0 407 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 KLHL35Q6PF15 583 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 DLEU7Q6UYE1 221 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 COMMD6Q7Z4G1 85 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 DHFR2Q86XF0 187 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 HIPK4Q8NE63 616 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 TNIP2Q8NFZ5 429 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 OR8J3Q8NGG0 315 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 OR8J2Q8NGG1 315 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 CDC26Q8NHZ8 85 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 DNASE2BQ8WZ79 361 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 ZUFSPQ96AP4 578 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 MTERF3Q96E29 417 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 EGLN2Q96KS0 407 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 NRTNQ99748 197 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC39A3Q9BRY0 314 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 EBPLQ9BY08 206 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM15Q9C019 465 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 MUC13Q9H3R2 512 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 CMTM6Q9NX76 183 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 ADAM29Q9UKF5 820 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 PACSIN3Q9UKS6 424 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 OR6C74A6NCV1 312 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 ASPDHA6ND91 283 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 PRORSD1PA6NEY8 169 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 GABRR3A8MPY1 467 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 C2orf74A8MZ97 194 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 K7ESF4 209 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 FXYD1O00168 92 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 BTN3A3O00478 584 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 NME4O00746 187 aa9.66□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.3 ms