RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308020.5

PTDSS2-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS2, Length 2,445 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2-201ENST00000308020 NDUFAF4Q9P032 175 aa20.19■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 BTNL2Q9UIR0 455 aa20.19■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 PADI2Q9Y2J8 665 aa20.19■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 CARNS1A5YM72 827 aa20.18■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 MGAT4DA6NG13 374 aa20.18■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 H0YIV9 168 aa20.18■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 TNFRSF11BO00300 401 aa20.18■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 MOSPD3O75425 235 aa20.18■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 ZNF30P17039 623 aa20.18■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 IDSP22304 550 aa20.18■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 SLC19A1P41440 591 aa20.18■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 CRATP43155 626 aa20.18■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 OR1E2P47887 323 aa20.18■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 COX20Q5RI15 118 aa20.18■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 GRHL2Q6ISB3 625 aa20.18■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 ZNF852Q6ZMS4 543 aa20.18■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 NEK10Q6ZWH5 1172 aa20.18■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 SLC5A8Q8N695 610 aa20.18■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 OR4A15Q8NGL6 344 aa20.18■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 PSMA8Q8TAA3 256 aa20.18■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 RLIMQ9NVW2 624 aa20.18■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa20.18■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 SLC16A8O95907 504 aa20.18■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 CTSLP07711 333 aa20.18■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 PCGF2P35227 344 aa20.18■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 MAGEA8P43361 318 aa20.18■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 BDKRB1P46663 353 aa20.18■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 KCNC3Q14003 757 aa20.18■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 RASGRP3Q8IV61 690 aa20.18■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 CCDC103Q8IW40 242 aa20.18■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 MINDY2Q8NBR6 621 aa20.18■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 C11orf65Q8NCR3 313 aa20.18■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 OR7G3Q8NG95 312 aa20.18■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 OR4K1Q8NGD4 311 aa20.18■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 HUS1BQ8NHY5 278 aa20.18■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 STARD8Q92502 1023 aa20.18■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 ITPKCQ96DU7 683 aa20.18■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 EPS8L2Q9H6S3 715 aa20.18■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 WASH3PC4AMC7 463 aa20.17■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 M0R082 166 aa20.17■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 TSPAN6O43657 245 aa20.17■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 AIREO43918 545 aa20.17■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 DPM1O60762 260 aa20.17■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 RHOP08100 348 aa20.17■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 ETFAP13804 333 aa20.17■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 HNF4AP41235 474 aa20.17■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 ASMTP46597 345 aa20.17■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 NUDT6P53370 316 aa20.17■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 ZNF33BQ06732 778 aa20.17■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.823e-6■■■□□ 14.7
PTDSS2-201ENST00000308020 SYTL3Q4VX76 610 aa20.17■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 SLC22A16Q86VW1 577 aa20.17■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 RHOXF1Q8NHV9 184 aa20.17■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 DACH2Q96NX9 599 aa20.17■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 SPATA9Q9BWV2 254 aa20.17■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 GIN1Q9NXP7 522 aa20.17■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa20.17■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 GBAP04062 536 aa20.17■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 ALOX5P09917 674 aa20.17■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 HLA-EP13747 358 aa20.17■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 TIMP2P16035 220 aa20.17■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 FUT4P22083 530 aa20.17■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 GGT2P36268 569 aa20.17■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 IDH2P48735 452 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 CTSCP53634 463 aa20.17■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 SELENOWP63302 87 aa20.17■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 NTHL1P78549 312 aa20.17■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 ZNF385BQ569K4 471 aa20.17■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 SAMD11Q96NU1 681 aa20.17■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 GPATCH2Q9NW75 528 aa20.17■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 AQP9O43315 295 aa20.16■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 XPAP23025 273 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 PPIBP23284 216 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 GADD45AP24522 165 aa20.16■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 NNMTP40261 264 aa20.16■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 RPS13P62277 151 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 CSNK2BP67870 215 aa20.16■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 ELP6Q0PNE2 266 aa20.16■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 TIGD6Q17RP2 521 aa20.16■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 CYP27C1Q4G0S4 372 aa20.16■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 ANXA8L1Q5VT79 327 aa20.16■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 ZSWIM3Q96MP5 696 aa20.16■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 PSD2Q9BQI7 771 aa20.16■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa20.16■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 BRF2Q9HAW0 419 aa20.16■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 RAD18Q9NS91 495 aa20.16■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 SACM1LQ9NTJ5 587 aa20.16■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 CORO2BQ9UQ03 480 aa20.16■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 HELZP42694 1942 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 CD40LGP29965 261 aa20.16■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 PPP5CP53041 499 aa20.16■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.9 ms