RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa21.76■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 SOCS2O14508 198 aa21.76■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 CREG1O75629 220 aa21.76■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 SEMA3DO95025 777 aa21.76■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 FCGR1AP12314 374 aa21.76■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 BSGP35613 385 aa21.76■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 CCT8P50990 548 aa21.76■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 GAB1Q13480 694 aa21.76■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 C6orf52Q5T4I8 152 aa21.76■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa21.76■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 SERPINA11Q86U17 422 aa21.76■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 NRROSQ86YC3 692 aa21.76■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 OR2L3Q8NG85 312 aa21.76■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 HLA-CQ95604 372 aa21.76■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 PPCDCQ96CD2 204 aa21.76■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 GPR174Q9BXC1 333 aa21.76■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa21.76■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 AP4B1Q9Y6B7 739 aa21.76■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 C1orf226A1L170 272 aa21.75■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 PDLIM1O00151 329 aa21.75■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 SERPIND1P05546 499 aa21.75■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 GPX2P18283 190 aa21.75■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 SERPINB1P30740 379 aa21.75■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 GPR155Q7Z3F1 870 aa21.75■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa21.75■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 AMIGO1Q86WK6 493 aa21.75■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa21.75■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 OR4A15Q8NGL6 344 aa21.75■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 LCN9Q8WX39 176 aa21.75■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 RLN3Q8WXF3 142 aa21.75■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 PHF12Q96QT6 1004 aa21.75■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 TPT1P8Q9HAU6 139 aa21.75■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 LHX9Q9NQ69 397 aa21.75■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 ATAD3AQ9NVI7 634 aa21.75■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 RAB26Q9ULW5 256 aa21.75■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 A6NCN8 305 aa21.75■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 STATHP02808 62 aa21.75■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 SLC19A1P41440 591 aa21.75■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC32Q14392 662 aa21.75■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 NKG7Q16617 165 aa21.75■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 CREB3L4Q8TEY5 395 aa21.75■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF597Q96LX8 424 aa21.75■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 DPH7Q9BTV6 452 aa21.75■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 DUSP12Q9UNI6 340 aa21.75■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 KLHL20Q9Y2M5 609 aa21.75■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 HAT1O14929 419 aa21.74■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 DENRO43583 198 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
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VSTM4-201ENST00000298454 RABIFP47224 123 aa21.74■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 CCR5P51681 352 aa21.74■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 HBA1P69905 142 aa21.74■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 ATP6AP1Q15904 470 aa21.74■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 OR52E4Q8NGH9 312 aa21.74■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 TPSD1Q9BZJ3 242 aa21.74■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 OAZ3Q9UMX2 235 aa21.74■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 TRBC2A0A5B9 178 aa21.74■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 ISM1B1AKI9 464 aa21.74■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa21.74■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 PPM1DO15297 605 aa21.74■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 NDUFS4O43181 175 aa21.74■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 KDM1AO60341 852 aa21.74■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 PRKD3O94806 890 aa21.74■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 KCNK5O95279 499 aa21.74■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 C6orf47O95873 294 aa21.74■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 RAP2AP10114 183 aa21.74■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 SHMT2P34897 504 aa21.74■■□□□ 1.07
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VSTM4-201ENST00000298454 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa21.74■■□□□ 1.07
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VSTM4-201ENST00000298454 PPP4R4Q6NUP7 873 aa21.74■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 FAM180BQ6P0A1 224 aa21.74■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM154Q6P9G4 183 aa21.74■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 UBE3DQ7Z6J8 389 aa21.74■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 CBR4Q8N4T8 237 aa21.74■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 TSTD1Q8NFU3 115 aa21.74■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 MACROD1Q9BQ69 325 aa21.74■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 AICDAQ9GZX7 198 aa21.74■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa21.74■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 UTS2RQ9UKP6 389 aa21.74■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa21.74■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 MAGEA13PA6NCF6 341 aa21.73■■□□□ 1.07
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