RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 NCEH1Q6PIU2 408 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 NPLOC4Q8TAT6 608 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 MOAP1Q96BY2 351 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 FRMD6Q96NE9 622 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 INSL5Q9Y5Q6 135 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 SCDO00767 359 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 SLC16A5O15375 505 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 MMP20O60882 483 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 SOX14O95416 240 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 CH25HO95992 272 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 HACD2Q6Y1H2 254 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 TCEANCQ8N8B7 351 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 NLGN2Q8NFZ4 835 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 AUTS2Q8WXX7 1259 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 CERS4Q9HA82 394 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 CENPMQ9NSP4 180 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 TYRP14679 529 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 ABCA11PQ4W5N1 156 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 PAQR7Q86WK9 346 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 SLC35E2BP0CK96 405 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 GJA1P17302 382 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 SLC6A6P31641 620 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 CD83Q01151 205 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 STEAP4Q687X5 459 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 DENND1AQ8TEH3 1009 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 MRGPRX2Q96LB1 330 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 FUZQ9BT04 418 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 TRPV4Q9HBA0 871 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 FMN2Q9NZ56 1722 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 CLIC3O95833 236 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 UQCRC2P22695 453 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 HSDL2Q6YN16 418 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 WDTC1Q8N5D0 677 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 WDR45Q9Y484 360 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 MT-ND5P03915 603 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 PDHA2P29803 388 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 PDX1P52945 283 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 CBFBQ13951 182 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 SMU1Q2TAY7 513 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 ZFAND4Q86XD8 727 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 MINDY1Q8N5J2 469 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 LMO7Q8WWI1 1683 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 CCRL2O00421 344 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 SLITRK5O94991 958 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 HSD3B1P14060 373 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 FSHRP23945 695 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 GADD45AP24522 165 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 HSD3B2P26439 372 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 NRIP1P48552 1158 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.868e-9■■□□□ 11.4
CCSAP-201ENST00000284617 C6orf141Q5SZD1 244 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 SLC15A3Q8IY34 581 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC54Q8NEL0 328 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 SPATA9Q9BWV2 254 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 AIG1Q9NVV5 245 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0D9SEW6 157 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 FAM72CH0Y354 149 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 TNFP01375 233 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 EPCAMP16422 314 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 FAM72AQ5TYM5 149 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 FAM72DQ6L9T8 149 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 FAM72BQ86X60 149 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 SLC37A3Q8NCC5 494 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 TSPAN4O14817 238 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 ACRP10323 421 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 STOMP27105 288 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 RAB8AP61006 207 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 FADDQ13158 208 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 VMACQ2NL98 169 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 KLHL26Q53HC5 615 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF367Q7RTV3 350 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF366Q8N895 744 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 ASPNQ9BXN1 380 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 OARD1Q9Y530 152 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 CDH10Q9Y6N8 788 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 RICTORQ6R327 1708 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 SNAPC5O75971 98 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 RPP14O95059 124 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 DECR1Q16698 335 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 UNC50Q53HI1 259 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 SLC29A4Q7RTT9 530 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 SPAG16Q8N0X2 631 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 PCYT2Q99447 389 aa20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms