RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 V9GYQ6 96 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 SCN8AQ9UQD0 1980 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD28O15084 1053 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC22A1O15245 554 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC16A6O15403 523 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 RAD23AP54725 363 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 FZD2Q14332 565 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 STPG1Q5TH74 334 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 EID3Q8N140 333 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 CDYL2Q8N8U2 506 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 NODALQ96S42 347 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 APOOQ9BUR5 198 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 LSM1O15116 133 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 SERPINB10P48595 397 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 METTL6Q8TCB7 284 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 FBLIM1Q8WUP2 373 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 AP2M1Q96CW1 435 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC47A1Q96FL8 570 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM9BQ9NQ34 198 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 NECTIN3Q9NQS3 549 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 M0QX08 132 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 SCAMP1O15126 338 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 PCSK2P16519 638 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 BPIP17213 487 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 MTPNP58546 118 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 ERVPABLB-1P60509 514 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 HIPK1Q86Z02 1210 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 GNGT2O14610 69 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 OTCP00480 354 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 G6PDP11413 515 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM23P36406 574 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 RABIFP47224 123 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF691Q5VV52 312 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 RAET1GQ6H3X3 334 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 SETD9Q8NE22 299 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 OR4K2Q8NGD2 314 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC13A3Q8WWT9 602 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 ACTL8Q9H568 366 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 PIF1Q9H611 641 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 ACTR8Q9H981 624 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 ADGRE2Q9UHX3 823 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 ELOVL7A1L3X0 281 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM202A6NGA9 273 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR39O43194 453 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 SDC3O75056 442 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 ESR1P03372 595 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 NTRK1P04629 796 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 IL6P05231 212 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 LPOP22079 712 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 SELPLGQ14242 412 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 KIAA0040Q15053 153 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 NR6A1Q15406 480 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 IL27RAQ6UWB1 636 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 GATAD2AQ86YP4 633 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 LINGO1Q96FE5 620 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 PSD2Q9BQI7 771 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa25.31■■□□□ 1.64
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CAPNS1-201ENST00000246533 SLC1A7O00341 560 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 GABARAPO95166 117 aa25.31■■□□□ 1.64
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CAPNS1-201ENST00000246533 ITGAMP11215 1152 aa25.31■■□□□ 1.64
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CAPNS1-201ENST00000246533 ISL1P61371 349 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 CYP4F3Q08477 520 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 CD47Q08722 323 aa25.31■■□□□ 1.64
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CAPNS1-201ENST00000246533 CD200R1Q8TD46 325 aa25.31■■□□□ 1.64
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CAPNS1-201ENST00000246533 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
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CAPNS1-201ENST00000246533 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 ASIC5Q9NY37 505 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 IL17CQ9P0M4 197 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 CAPN1P07384 714 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 IL7RP16871 459 aa25.3■■□□□ 1.64
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