RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1B0GVC2 190 aa15.29■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 FEZF1A0PJY2 475 aa15.29■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 FCHO1O14526 889 aa15.29■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 TXNDC9O14530 226 aa15.29■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 OR1I1O60431 355 aa15.29■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 TJP3O95049 919 aa15.29■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 METTL18O95568 372 aa15.29■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 PSMA3P25788 255 aa15.29■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 POU4F3Q15319 338 aa15.29■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 NSDHLQ15738 373 aa15.29■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 PLPP5Q8NEB5 264 aa15.29■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 ASZ1Q8WWH4 475 aa15.29■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 LRRC46Q96FV0 321 aa15.29■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 MAGEB17A8MXT2 336 aa15.28■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 C1orf105O95561 183 aa15.28■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 EZRP15311 586 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 BMP5P22003 454 aa15.28■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 FOXN2P32314 431 aa15.28■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 GDF10P55107 478 aa15.28■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 OR4D2P58180 307 aa15.28■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 MPP1Q00013 466 aa15.28■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 NDUFA9Q16795 377 aa15.28■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 SEM1Q6ZVN7 128 aa15.28■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 TRILQ7L0X0 811 aa15.28■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 FAM71DQ8N9W8 422 aa15.28■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 NAXEQ8NCW5 288 aa15.28■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 LINC01560Q8TB33 94 aa15.28■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 CNPPD1Q9BV87 410 aa15.28■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 LANCL2Q9NS86 450 aa15.28■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 PYCARDQ9ULZ3 195 aa15.28■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa15.28■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 NFS1Q9Y697 457 aa15.28■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 SVEP1Q4LDE5 3571 aa15.28■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 A0A0G2JMM0 328 aa15.27■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1W2PPB8 328 aa15.27■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1W2PRS3 328 aa15.27■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 OR51F1A6NGY5 319 aa15.27■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 HSPB2A8KAH6 182 aa15.27■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 KIR3DP1A8MWS1 328 aa15.27■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 ACOT7O00154 380 aa15.27■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 AQP7O14520 342 aa15.27■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 DVL2O14641 736 aa15.27■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 SLC16A5O15375 505 aa15.27■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 GLSO94925 669 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 IFNA2P01563 188 aa15.27■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 TUBB4AP04350 444 aa15.27■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 TPH1P17752 444 aa15.27■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 BCL6P41182 706 aa15.27■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 POU6F1Q14863 301 aa15.27■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 HSPB2Q16082 182 aa15.27■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 PARP6Q2NL67 630 aa15.27■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 POMZP3Q6PJE2 187 aa15.27■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 RGS9BPQ6ZS82 235 aa15.27■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 RAB42Q8N4Z0 105 aa15.27■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 SLC35B2Q8TB61 432 aa15.27■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 YIPF4Q9BSR8 244 aa15.27■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 RBCK1Q9BYM8 510 aa15.27■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 TTTY12Q9BZ98 90 aa15.27■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 LRRC40Q9H9A6 602 aa15.27■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 SPATA7Q9P0W8 599 aa15.27■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 PCYOX1Q9UHG3 505 aa15.27■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 TGP01266 2768 aa15.26■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa15.26■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 MROH6A6NGR9 719 aa15.26■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 CLDN4O14493 209 aa15.26■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 STATHP02808 62 aa15.26■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 ERGP11308 486 aa15.26■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 PKMP14618 531 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 IL1RNP18510 177 aa15.26■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 SORDQ00796 357 aa15.26■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 RELAQ04206 551 aa15.26■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 TTC23LQ6PF05 361 aa15.26■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM139Q8IV31 216 aa15.26■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 PSD4Q8NDX1 1056 aa15.26■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 OR2M7Q8NG81 312 aa15.26■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 STYXQ8WUJ0 223 aa15.26■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 PIGTQ969N2 578 aa15.26■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 IQCF5A8MTL0 148 aa15.25■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 SGK494L7N484 410 aa15.25■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 HAT1O14929 419 aa15.25■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 APOA4P06727 396 aa15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.6 ms